Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA5

Zcchc12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc12Q9CZA5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc12Q9CZA5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc12Q9CZA5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc12Q9CZA5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc12Q9CZA5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc12Q9CZA5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc12Q9CZA5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc12Q9CZA5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc12Q9CZA5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc12Q9CZA5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc12Q9CZA5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zcchc12Q9CZA5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc12Q9CZA5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc12Q9CZA5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc12Q9CZA5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc12Q9CZA5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc12Q9CZA5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc12Q9CZA5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc12Q9CZA5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc12Q9CZA5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc12Q9CZA5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zcchc12Q9CZA5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc12Q9CZA5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zcchc12Q9CZA5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc12Q9CZA5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc12Q9CZA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc12Q9CZA5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms