Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrtapQ9CYD3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CrtapQ9CYD3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrtapQ9CYD3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrtapQ9CYD3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrtapQ9CYD3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrtapQ9CYD3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrtapQ9CYD3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrtapQ9CYD3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrtapQ9CYD3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrtapQ9CYD3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrtapQ9CYD3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrtapQ9CYD3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrtapQ9CYD3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrtapQ9CYD3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrtapQ9CYD3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrtapQ9CYD3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CrtapQ9CYD3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CrtapQ9CYD3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CrtapQ9CYD3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrtapQ9CYD3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CrtapQ9CYD3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CrtapQ9CYD3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CrtapQ9CYD3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CrtapQ9CYD3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrtapQ9CYD3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrtapQ9CYD3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrtapQ9CYD3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrtapQ9CYD3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrtapQ9CYD3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CrtapQ9CYD3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CrtapQ9CYD3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CrtapQ9CYD3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CrtapQ9CYD3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrtapQ9CYD3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrtapQ9CYD3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrtapQ9CYD3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrtapQ9CYD3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrtapQ9CYD3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrtapQ9CYD3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrtapQ9CYD3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrtapQ9CYD3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrtapQ9CYD3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrtapQ9CYD3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrtapQ9CYD3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrtapQ9CYD3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrtapQ9CYD3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CrtapQ9CYD3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrtapQ9CYD3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrtapQ9CYD3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CrtapQ9CYD3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CrtapQ9CYD3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrtapQ9CYD3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrtapQ9CYD3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrtapQ9CYD3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrtapQ9CYD3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrtapQ9CYD3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrtapQ9CYD3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrtapQ9CYD3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrtapQ9CYD3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrtapQ9CYD3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrtapQ9CYD3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrtapQ9CYD3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrtapQ9CYD3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrtapQ9CYD3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrtapQ9CYD3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrtapQ9CYD3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrtapQ9CYD3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrtapQ9CYD3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrtapQ9CYD3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrtapQ9CYD3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrtapQ9CYD3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrtapQ9CYD3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrtapQ9CYD3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrtapQ9CYD3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrtapQ9CYD3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrtapQ9CYD3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrtapQ9CYD3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CrtapQ9CYD3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrtapQ9CYD3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrtapQ9CYD3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrtapQ9CYD3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms