Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
RpainQ9CWY9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
RpainQ9CWY9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
RpainQ9CWY9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
RpainQ9CWY9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
RpainQ9CWY9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
RpainQ9CWY9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
RpainQ9CWY9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
RpainQ9CWY9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
RpainQ9CWY9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
RpainQ9CWY9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
RpainQ9CWY9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
RpainQ9CWY9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
RpainQ9CWY9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
RpainQ9CWY9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
RpainQ9CWY9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
RpainQ9CWY9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
RpainQ9CWY9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
RpainQ9CWY9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
RpainQ9CWY9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
RpainQ9CWY9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
RpainQ9CWY9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
RpainQ9CWY9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
RpainQ9CWY9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
RpainQ9CWY9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
RpainQ9CWY9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,9■■■□□ 2,06
RpainQ9CWY9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
RpainQ9CWY9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
RpainQ9CWY9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
RpainQ9CWY9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
RpainQ9CWY9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
RpainQ9CWY9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
RpainQ9CWY9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
RpainQ9CWY9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,83■■■□□ 2,05
RpainQ9CWY9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
RpainQ9CWY9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
RpainQ9CWY9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
RpainQ9CWY9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
RpainQ9CWY9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
RpainQ9CWY9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
RpainQ9CWY9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
RpainQ9CWY9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
RpainQ9CWY9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
RpainQ9CWY9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
RpainQ9CWY9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
RpainQ9CWY9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
RpainQ9CWY9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
RpainQ9CWY9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
RpainQ9CWY9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
RpainQ9CWY9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
RpainQ9CWY9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
RpainQ9CWY9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
RpainQ9CWY9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
RpainQ9CWY9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
RpainQ9CWY9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
RpainQ9CWY9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,55■■■□□ 2
RpainQ9CWY9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
RpainQ9CWY9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
RpainQ9CWY9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
RpainQ9CWY9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
RpainQ9CWY9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
RpainQ9CWY9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
RpainQ9CWY9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
RpainQ9CWY9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,4■■□□□ 1,98
RpainQ9CWY9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
RpainQ9CWY9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
RpainQ9CWY9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
RpainQ9CWY9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,32■■□□□ 1,96
RpainQ9CWY9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
RpainQ9CWY9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
RpainQ9CWY9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
RpainQ9CWY9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
RpainQ9CWY9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
RpainQ9CWY9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
RpainQ9CWY9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
RpainQ9CWY9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
RpainQ9CWY9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
RpainQ9CWY9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
RpainQ9CWY9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
RpainQ9CWY9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
RpainQ9CWY9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
RpainQ9CWY9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
RpainQ9CWY9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
RpainQ9CWY9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
RpainQ9CWY9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
RpainQ9CWY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
RpainQ9CWY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
RpainQ9CWY9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
RpainQ9CWY9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
RpainQ9CWY9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
RpainQ9CWY9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
RpainQ9CWY9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
RpainQ9CWY9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
RpainQ9CWY9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27■■□□□ 1,91
RpainQ9CWY9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1,91
RpainQ9CWY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
RpainQ9CWY9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
RpainQ9CWY9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
RpainQ9CWY9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
RpainQ9CWY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
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