Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RpainQ9CWY9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RpainQ9CWY9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RpainQ9CWY9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RpainQ9CWY9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RpainQ9CWY9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RpainQ9CWY9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RpainQ9CWY9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RpainQ9CWY9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RpainQ9CWY9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RpainQ9CWY9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RpainQ9CWY9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RpainQ9CWY9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RpainQ9CWY9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RpainQ9CWY9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RpainQ9CWY9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RpainQ9CWY9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RpainQ9CWY9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RpainQ9CWY9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RpainQ9CWY9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RpainQ9CWY9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RpainQ9CWY9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RpainQ9CWY9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RpainQ9CWY9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RpainQ9CWY9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RpainQ9CWY9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RpainQ9CWY9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RpainQ9CWY9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RpainQ9CWY9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RpainQ9CWY9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RpainQ9CWY9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RpainQ9CWY9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RpainQ9CWY9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RpainQ9CWY9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RpainQ9CWY9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RpainQ9CWY9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RpainQ9CWY9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RpainQ9CWY9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RpainQ9CWY9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RpainQ9CWY9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RpainQ9CWY9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RpainQ9CWY9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RpainQ9CWY9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RpainQ9CWY9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RpainQ9CWY9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RpainQ9CWY9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RpainQ9CWY9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RpainQ9CWY9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RpainQ9CWY9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RpainQ9CWY9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RpainQ9CWY9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RpainQ9CWY9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RpainQ9CWY9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RpainQ9CWY9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RpainQ9CWY9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RpainQ9CWY9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RpainQ9CWY9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RpainQ9CWY9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RpainQ9CWY9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RpainQ9CWY9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RpainQ9CWY9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RpainQ9CWY9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RpainQ9CWY9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RpainQ9CWY9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RpainQ9CWY9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RpainQ9CWY9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RpainQ9CWY9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RpainQ9CWY9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RpainQ9CWY9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RpainQ9CWY9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RpainQ9CWY9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RpainQ9CWY9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RpainQ9CWY9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RpainQ9CWY9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RpainQ9CWY9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RpainQ9CWY9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RpainQ9CWY9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RpainQ9CWY9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RpainQ9CWY9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RpainQ9CWY9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RpainQ9CWY9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RpainQ9CWY9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RpainQ9CWY9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RpainQ9CWY9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RpainQ9CWY9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RpainQ9CWY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RpainQ9CWY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RpainQ9CWY9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RpainQ9CWY9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RpainQ9CWY9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RpainQ9CWY9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RpainQ9CWY9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RpainQ9CWY9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RpainQ9CWY9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27■■□□□ 1.91
RpainQ9CWY9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
RpainQ9CWY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RpainQ9CWY9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RpainQ9CWY9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RpainQ9CWY9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RpainQ9CWY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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