Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Snx10Q9CWT3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Snx10Q9CWT3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Snx10Q9CWT3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Snx10Q9CWT3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Snx10Q9CWT3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Snx10Q9CWT3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Snx10Q9CWT3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Snx10Q9CWT3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Snx10Q9CWT3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Snx10Q9CWT3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Snx10Q9CWT3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Snx10Q9CWT3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Snx10Q9CWT3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Snx10Q9CWT3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Snx10Q9CWT3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Snx10Q9CWT3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Snx10Q9CWT3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Snx10Q9CWT3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Snx10Q9CWT3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
Snx10Q9CWT3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Snx10Q9CWT3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Snx10Q9CWT3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Snx10Q9CWT3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Snx10Q9CWT3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Snx10Q9CWT3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Snx10Q9CWT3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Snx10Q9CWT3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Snx10Q9CWT3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Snx10Q9CWT3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Snx10Q9CWT3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Snx10Q9CWT3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Snx10Q9CWT3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Snx10Q9CWT3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Snx10Q9CWT3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Snx10Q9CWT3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Snx10Q9CWT3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Snx10Q9CWT3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Snx10Q9CWT3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Snx10Q9CWT3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Snx10Q9CWT3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,7■■■□□ 2,35
Snx10Q9CWT3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Snx10Q9CWT3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Snx10Q9CWT3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Snx10Q9CWT3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Snx10Q9CWT3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Snx10Q9CWT3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Snx10Q9CWT3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Snx10Q9CWT3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Snx10Q9CWT3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Snx10Q9CWT3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Snx10Q9CWT3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Snx10Q9CWT3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Snx10Q9CWT3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Snx10Q9CWT3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Snx10Q9CWT3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Snx10Q9CWT3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Snx10Q9CWT3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Snx10Q9CWT3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Snx10Q9CWT3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Snx10Q9CWT3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Snx10Q9CWT3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Snx10Q9CWT3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Snx10Q9CWT3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Snx10Q9CWT3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Snx10Q9CWT3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Snx10Q9CWT3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Snx10Q9CWT3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Snx10Q9CWT3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Snx10Q9CWT3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Snx10Q9CWT3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Snx10Q9CWT3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Snx10Q9CWT3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Snx10Q9CWT3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Snx10Q9CWT3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Snx10Q9CWT3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Snx10Q9CWT3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Snx10Q9CWT3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Snx10Q9CWT3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Snx10Q9CWT3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Snx10Q9CWT3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Snx10Q9CWT3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx10Q9CWT3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx10Q9CWT3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Snx10Q9CWT3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Snx10Q9CWT3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Snx10Q9CWT3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Snx10Q9CWT3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Snx10Q9CWT3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Snx10Q9CWT3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Snx10Q9CWT3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Snx10Q9CWT3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Snx10Q9CWT3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Snx10Q9CWT3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Snx10Q9CWT3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Snx10Q9CWT3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Snx10Q9CWT3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Snx10Q9CWT3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Snx10Q9CWT3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Snx10Q9CWT3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,4 ms