Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfdn1Q9CWM4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pfdn1Q9CWM4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfdn1Q9CWM4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfdn1Q9CWM4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfdn1Q9CWM4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfdn1Q9CWM4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pfdn1Q9CWM4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pfdn1Q9CWM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pfdn1Q9CWM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pfdn1Q9CWM4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn1Q9CWM4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pfdn1Q9CWM4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn1Q9CWM4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn1Q9CWM4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pfdn1Q9CWM4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pfdn1Q9CWM4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pfdn1Q9CWM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pfdn1Q9CWM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn1Q9CWM4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pfdn1Q9CWM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pfdn1Q9CWM4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pfdn1Q9CWM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pfdn1Q9CWM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pfdn1Q9CWM4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn1Q9CWM4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn1Q9CWM4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pfdn1Q9CWM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pfdn1Q9CWM4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pfdn1Q9CWM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn1Q9CWM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfdn1Q9CWM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfdn1Q9CWM4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfdn1Q9CWM4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfdn1Q9CWM4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfdn1Q9CWM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfdn1Q9CWM4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn1Q9CWM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn1Q9CWM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfdn1Q9CWM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn1Q9CWM4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfdn1Q9CWM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pfdn1Q9CWM4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pfdn1Q9CWM4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pfdn1Q9CWM4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pfdn1Q9CWM4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfdn1Q9CWM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfdn1Q9CWM4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pfdn1Q9CWM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pfdn1Q9CWM4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfdn1Q9CWM4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfdn1Q9CWM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfdn1Q9CWM4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfdn1Q9CWM4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfdn1Q9CWM4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pfdn1Q9CWM4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pfdn1Q9CWM4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pfdn1Q9CWM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pfdn1Q9CWM4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pfdn1Q9CWM4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pfdn1Q9CWM4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn1Q9CWM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn1Q9CWM4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn1Q9CWM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn1Q9CWM4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn1Q9CWM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn1Q9CWM4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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