Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
2310003L06RikQ9CV82 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
2310003L06RikQ9CV82 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
2310003L06RikQ9CV82 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
2310003L06RikQ9CV82 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
2310003L06RikQ9CV82 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
2310003L06RikQ9CV82 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
2310003L06RikQ9CV82 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
2310003L06RikQ9CV82 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
2310003L06RikQ9CV82 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
2310003L06RikQ9CV82 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
2310003L06RikQ9CV82 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
2310003L06RikQ9CV82 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
2310003L06RikQ9CV82 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
2310003L06RikQ9CV82 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
2310003L06RikQ9CV82 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
2310003L06RikQ9CV82 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
2310003L06RikQ9CV82 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
2310003L06RikQ9CV82 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
2310003L06RikQ9CV82 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
2310003L06RikQ9CV82 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
2310003L06RikQ9CV82 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
2310003L06RikQ9CV82 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
2310003L06RikQ9CV82 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
2310003L06RikQ9CV82 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
2310003L06RikQ9CV82 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
2310003L06RikQ9CV82 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
2310003L06RikQ9CV82 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
2310003L06RikQ9CV82 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
2310003L06RikQ9CV82 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
2310003L06RikQ9CV82 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
2310003L06RikQ9CV82 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
2310003L06RikQ9CV82 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
2310003L06RikQ9CV82 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
2310003L06RikQ9CV82 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
2310003L06RikQ9CV82 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
2310003L06RikQ9CV82 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
2310003L06RikQ9CV82 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
2310003L06RikQ9CV82 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
2310003L06RikQ9CV82 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
2310003L06RikQ9CV82 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
2310003L06RikQ9CV82 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
2310003L06RikQ9CV82 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
2310003L06RikQ9CV82 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
2310003L06RikQ9CV82 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
2310003L06RikQ9CV82 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
2310003L06RikQ9CV82 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
2310003L06RikQ9CV82 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
2310003L06RikQ9CV82 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
2310003L06RikQ9CV82 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
2310003L06RikQ9CV82 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
2310003L06RikQ9CV82 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
2310003L06RikQ9CV82 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
2310003L06RikQ9CV82 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
2310003L06RikQ9CV82 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
2310003L06RikQ9CV82 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
2310003L06RikQ9CV82 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
2310003L06RikQ9CV82 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
2310003L06RikQ9CV82 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
2310003L06RikQ9CV82 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
2310003L06RikQ9CV82 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
2310003L06RikQ9CV82 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
2310003L06RikQ9CV82 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
2310003L06RikQ9CV82 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
2310003L06RikQ9CV82 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
2310003L06RikQ9CV82 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
2310003L06RikQ9CV82 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
2310003L06RikQ9CV82 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
2310003L06RikQ9CV82 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
2310003L06RikQ9CV82 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
2310003L06RikQ9CV82 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
2310003L06RikQ9CV82 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
2310003L06RikQ9CV82 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
2310003L06RikQ9CV82 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
2310003L06RikQ9CV82 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
2310003L06RikQ9CV82 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
2310003L06RikQ9CV82 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
2310003L06RikQ9CV82 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
2310003L06RikQ9CV82 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
2310003L06RikQ9CV82 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
2310003L06RikQ9CV82 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
2310003L06RikQ9CV82 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
2310003L06RikQ9CV82 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
2310003L06RikQ9CV82 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
2310003L06RikQ9CV82 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
2310003L06RikQ9CV82 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
2310003L06RikQ9CV82 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
2310003L06RikQ9CV82 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
2310003L06RikQ9CV82 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
2310003L06RikQ9CV82 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
2310003L06RikQ9CV82 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms