Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519P11RikQ9CUJ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519P11RikQ9CUJ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519P11RikQ9CUJ8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519P11RikQ9CUJ8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519P11RikQ9CUJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519P11RikQ9CUJ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519P11RikQ9CUJ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519P11RikQ9CUJ8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519P11RikQ9CUJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519P11RikQ9CUJ8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519P11RikQ9CUJ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519P11RikQ9CUJ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519P11RikQ9CUJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519P11RikQ9CUJ8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519P11RikQ9CUJ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519P11RikQ9CUJ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519P11RikQ9CUJ8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519P11RikQ9CUJ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930519P11RikQ9CUJ8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930519P11RikQ9CUJ8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930519P11RikQ9CUJ8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4930519P11RikQ9CUJ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519P11RikQ9CUJ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930519P11RikQ9CUJ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms