Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhfpl3Q9CTN8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhfpl3Q9CTN8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhfpl3Q9CTN8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhfpl3Q9CTN8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhfpl3Q9CTN8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhfpl3Q9CTN8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhfpl3Q9CTN8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhfpl3Q9CTN8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhfpl3Q9CTN8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhfpl3Q9CTN8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhfpl3Q9CTN8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lhfpl3Q9CTN8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lhfpl3Q9CTN8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhfpl3Q9CTN8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhfpl3Q9CTN8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhfpl3Q9CTN8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhfpl3Q9CTN8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhfpl3Q9CTN8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhfpl3Q9CTN8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhfpl3Q9CTN8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhfpl3Q9CTN8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhfpl3Q9CTN8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhfpl3Q9CTN8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhfpl3Q9CTN8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhfpl3Q9CTN8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhfpl3Q9CTN8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhfpl3Q9CTN8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhfpl3Q9CTN8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhfpl3Q9CTN8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhfpl3Q9CTN8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhfpl3Q9CTN8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhfpl3Q9CTN8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhfpl3Q9CTN8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhfpl3Q9CTN8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhfpl3Q9CTN8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhfpl3Q9CTN8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhfpl3Q9CTN8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhfpl3Q9CTN8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lhfpl3Q9CTN8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lhfpl3Q9CTN8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lhfpl3Q9CTN8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lhfpl3Q9CTN8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lhfpl3Q9CTN8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lhfpl3Q9CTN8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lhfpl3Q9CTN8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lhfpl3Q9CTN8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lhfpl3Q9CTN8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms