Protein–RNA interactions for Protein: Q9CT10

Ranbp3, Ran-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp3Q9CT10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ranbp3Q9CT10 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ranbp3Q9CT10 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ranbp3Q9CT10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ranbp3Q9CT10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ranbp3Q9CT10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ranbp3Q9CT10 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ranbp3Q9CT10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ranbp3Q9CT10 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ranbp3Q9CT10 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ranbp3Q9CT10 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ranbp3Q9CT10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ranbp3Q9CT10 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ranbp3Q9CT10 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ranbp3Q9CT10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ranbp3Q9CT10 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ranbp3Q9CT10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ranbp3Q9CT10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ranbp3Q9CT10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ranbp3Q9CT10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ranbp3Q9CT10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ranbp3Q9CT10 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ranbp3Q9CT10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ranbp3Q9CT10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp3Q9CT10 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp3Q9CT10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ranbp3Q9CT10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ranbp3Q9CT10 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ranbp3Q9CT10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ranbp3Q9CT10 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ranbp3Q9CT10 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ranbp3Q9CT10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ranbp3Q9CT10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ranbp3Q9CT10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ranbp3Q9CT10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ranbp3Q9CT10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ranbp3Q9CT10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ranbp3Q9CT10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ranbp3Q9CT10 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ranbp3Q9CT10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ranbp3Q9CT10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ranbp3Q9CT10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ranbp3Q9CT10 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ranbp3Q9CT10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ranbp3Q9CT10 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ranbp3Q9CT10 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ranbp3Q9CT10 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ranbp3Q9CT10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ranbp3Q9CT10 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ranbp3Q9CT10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ranbp3Q9CT10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ranbp3Q9CT10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ranbp3Q9CT10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ranbp3Q9CT10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ranbp3Q9CT10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ranbp3Q9CT10 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ranbp3Q9CT10 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ranbp3Q9CT10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ranbp3Q9CT10 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ranbp3Q9CT10 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ranbp3Q9CT10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ranbp3Q9CT10 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ranbp3Q9CT10 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ranbp3Q9CT10 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ranbp3Q9CT10 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ranbp3Q9CT10 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ranbp3Q9CT10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ranbp3Q9CT10 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ranbp3Q9CT10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ranbp3Q9CT10 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ranbp3Q9CT10 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ranbp3Q9CT10 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ranbp3Q9CT10 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ranbp3Q9CT10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ranbp3Q9CT10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ranbp3Q9CT10 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ranbp3Q9CT10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ranbp3Q9CT10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ranbp3Q9CT10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ranbp3Q9CT10 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ranbp3Q9CT10 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ranbp3Q9CT10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ranbp3Q9CT10 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ranbp3Q9CT10 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ranbp3Q9CT10 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ranbp3Q9CT10 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ranbp3Q9CT10 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ranbp3Q9CT10 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ranbp3Q9CT10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ranbp3Q9CT10 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ranbp3Q9CT10 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ranbp3Q9CT10 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms