Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700029F12RikQ9CRB4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700029F12RikQ9CRB4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700029F12RikQ9CRB4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700029F12RikQ9CRB4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700029F12RikQ9CRB4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700029F12RikQ9CRB4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700029F12RikQ9CRB4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700029F12RikQ9CRB4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
1700029F12RikQ9CRB4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700029F12RikQ9CRB4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700029F12RikQ9CRB4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700029F12RikQ9CRB4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700029F12RikQ9CRB4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700029F12RikQ9CRB4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700029F12RikQ9CRB4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700029F12RikQ9CRB4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700029F12RikQ9CRB4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700029F12RikQ9CRB4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700029F12RikQ9CRB4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700029F12RikQ9CRB4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700029F12RikQ9CRB4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700029F12RikQ9CRB4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700029F12RikQ9CRB4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700029F12RikQ9CRB4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700029F12RikQ9CRB4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
1700029F12RikQ9CRB4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700029F12RikQ9CRB4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700029F12RikQ9CRB4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700029F12RikQ9CRB4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700029F12RikQ9CRB4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700029F12RikQ9CRB4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700029F12RikQ9CRB4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700029F12RikQ9CRB4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
1700029F12RikQ9CRB4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700029F12RikQ9CRB4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700029F12RikQ9CRB4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
1700029F12RikQ9CRB4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700029F12RikQ9CRB4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700029F12RikQ9CRB4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700029F12RikQ9CRB4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700029F12RikQ9CRB4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700029F12RikQ9CRB4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700029F12RikQ9CRB4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700029F12RikQ9CRB4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700029F12RikQ9CRB4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700029F12RikQ9CRB4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700029F12RikQ9CRB4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700029F12RikQ9CRB4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms