Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pop4Q9CR08 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pop4Q9CR08 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pop4Q9CR08 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pop4Q9CR08 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pop4Q9CR08 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pop4Q9CR08 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pop4Q9CR08 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pop4Q9CR08 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pop4Q9CR08 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pop4Q9CR08 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pop4Q9CR08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pop4Q9CR08 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pop4Q9CR08 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pop4Q9CR08 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pop4Q9CR08 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pop4Q9CR08 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pop4Q9CR08 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pop4Q9CR08 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pop4Q9CR08 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pop4Q9CR08 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pop4Q9CR08 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pop4Q9CR08 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pop4Q9CR08 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pop4Q9CR08 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pop4Q9CR08 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pop4Q9CR08 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pop4Q9CR08 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pop4Q9CR08 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pop4Q9CR08 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pop4Q9CR08 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pop4Q9CR08 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pop4Q9CR08 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pop4Q9CR08 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pop4Q9CR08 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pop4Q9CR08 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pop4Q9CR08 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pop4Q9CR08 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pop4Q9CR08 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pop4Q9CR08 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pop4Q9CR08 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pop4Q9CR08 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pop4Q9CR08 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pop4Q9CR08 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pop4Q9CR08 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pop4Q9CR08 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pop4Q9CR08 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pop4Q9CR08 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pop4Q9CR08 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pop4Q9CR08 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pop4Q9CR08 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pop4Q9CR08 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pop4Q9CR08 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pop4Q9CR08 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pop4Q9CR08 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pop4Q9CR08 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pop4Q9CR08 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pop4Q9CR08 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pop4Q9CR08 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pop4Q9CR08 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pop4Q9CR08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pop4Q9CR08 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pop4Q9CR08 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pop4Q9CR08 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pop4Q9CR08 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pop4Q9CR08 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pop4Q9CR08 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pop4Q9CR08 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pop4Q9CR08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pop4Q9CR08 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pop4Q9CR08 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pop4Q9CR08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pop4Q9CR08 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pop4Q9CR08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop4Q9CR08 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop4Q9CR08 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop4Q9CR08 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop4Q9CR08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop4Q9CR08 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop4Q9CR08 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop4Q9CR08 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop4Q9CR08 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pop4Q9CR08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop4Q9CR08 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pop4Q9CR08 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pop4Q9CR08 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pop4Q9CR08 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pop4Q9CR08 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pop4Q9CR08 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pop4Q9CR08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms