Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psmd9Q9CR00 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmd9Q9CR00 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmd9Q9CR00 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmd9Q9CR00 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmd9Q9CR00 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmd9Q9CR00 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psmd9Q9CR00 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psmd9Q9CR00 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmd9Q9CR00 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psmd9Q9CR00 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmd9Q9CR00 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmd9Q9CR00 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psmd9Q9CR00 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmd9Q9CR00 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmd9Q9CR00 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmd9Q9CR00 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmd9Q9CR00 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmd9Q9CR00 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmd9Q9CR00 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psmd9Q9CR00 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psmd9Q9CR00 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psmd9Q9CR00 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Psmd9Q9CR00 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psmd9Q9CR00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psmd9Q9CR00 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Psmd9Q9CR00 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psmd9Q9CR00 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psmd9Q9CR00 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psmd9Q9CR00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Psmd9Q9CR00 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psmd9Q9CR00 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psmd9Q9CR00 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psmd9Q9CR00 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psmd9Q9CR00 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psmd9Q9CR00 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psmd9Q9CR00 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Psmd9Q9CR00 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psmd9Q9CR00 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psmd9Q9CR00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psmd9Q9CR00 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psmd9Q9CR00 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psmd9Q9CR00 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psmd9Q9CR00 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psmd9Q9CR00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Psmd9Q9CR00 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psmd9Q9CR00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psmd9Q9CR00 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psmd9Q9CR00 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psmd9Q9CR00 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psmd9Q9CR00 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psmd9Q9CR00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psmd9Q9CR00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psmd9Q9CR00 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Psmd9Q9CR00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psmd9Q9CR00 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd9Q9CR00 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd9Q9CR00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd9Q9CR00 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psmd9Q9CR00 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psmd9Q9CR00 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psmd9Q9CR00 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psmd9Q9CR00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd9Q9CR00 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psmd9Q9CR00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psmd9Q9CR00 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd9Q9CR00 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd9Q9CR00 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psmd9Q9CR00 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmd9Q9CR00 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmd9Q9CR00 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psmd9Q9CR00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmd9Q9CR00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmd9Q9CR00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmd9Q9CR00 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmd9Q9CR00 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd9Q9CR00 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd9Q9CR00 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd9Q9CR00 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd9Q9CR00 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmd9Q9CR00 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmd9Q9CR00 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd9Q9CR00 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd9Q9CR00 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd9Q9CR00 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd9Q9CR00 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmd9Q9CR00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmd9Q9CR00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmd9Q9CR00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmd9Q9CR00 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmd9Q9CR00 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmd9Q9CR00 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms