Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tm4sf20Q9CQY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tm4sf20Q9CQY8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tm4sf20Q9CQY8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tm4sf20Q9CQY8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm4sf20Q9CQY8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tm4sf20Q9CQY8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm4sf20Q9CQY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tm4sf20Q9CQY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm4sf20Q9CQY8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm4sf20Q9CQY8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tm4sf20Q9CQY8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tm4sf20Q9CQY8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tm4sf20Q9CQY8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tm4sf20Q9CQY8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm4sf20Q9CQY8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tm4sf20Q9CQY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tm4sf20Q9CQY8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm4sf20Q9CQY8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm4sf20Q9CQY8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm4sf20Q9CQY8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm4sf20Q9CQY8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm4sf20Q9CQY8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm4sf20Q9CQY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm4sf20Q9CQY8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm4sf20Q9CQY8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tm4sf20Q9CQY8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tm4sf20Q9CQY8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tm4sf20Q9CQY8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tm4sf20Q9CQY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tm4sf20Q9CQY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tm4sf20Q9CQY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tm4sf20Q9CQY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tm4sf20Q9CQY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tm4sf20Q9CQY8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tm4sf20Q9CQY8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tm4sf20Q9CQY8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tm4sf20Q9CQY8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tm4sf20Q9CQY8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm4sf20Q9CQY8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tm4sf20Q9CQY8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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