Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl20Q9CQL4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl20Q9CQL4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl20Q9CQL4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl20Q9CQL4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl20Q9CQL4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl20Q9CQL4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl20Q9CQL4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl20Q9CQL4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl20Q9CQL4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl20Q9CQL4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl20Q9CQL4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl20Q9CQL4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl20Q9CQL4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl20Q9CQL4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl20Q9CQL4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mrpl20Q9CQL4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl20Q9CQL4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl20Q9CQL4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl20Q9CQL4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl20Q9CQL4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl20Q9CQL4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl20Q9CQL4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl20Q9CQL4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl20Q9CQL4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl20Q9CQL4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl20Q9CQL4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl20Q9CQL4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl20Q9CQL4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl20Q9CQL4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl20Q9CQL4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl20Q9CQL4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl20Q9CQL4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl20Q9CQL4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl20Q9CQL4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl20Q9CQL4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl20Q9CQL4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl20Q9CQL4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl20Q9CQL4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl20Q9CQL4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl20Q9CQL4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl20Q9CQL4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl20Q9CQL4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl20Q9CQL4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl20Q9CQL4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl20Q9CQL4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl20Q9CQL4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl20Q9CQL4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl20Q9CQL4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl20Q9CQL4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl20Q9CQL4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl20Q9CQL4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl20Q9CQL4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl20Q9CQL4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl20Q9CQL4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl20Q9CQL4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl20Q9CQL4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl20Q9CQL4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl20Q9CQL4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl20Q9CQL4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl20Q9CQL4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl20Q9CQL4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl20Q9CQL4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl20Q9CQL4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl20Q9CQL4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl20Q9CQL4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl20Q9CQL4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl20Q9CQL4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl20Q9CQL4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl20Q9CQL4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl20Q9CQL4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl20Q9CQL4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl20Q9CQL4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl20Q9CQL4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl20Q9CQL4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl20Q9CQL4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl20Q9CQL4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl20Q9CQL4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl20Q9CQL4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mrpl20Q9CQL4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl20Q9CQL4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl20Q9CQL4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl20Q9CQL4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl20Q9CQL4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl20Q9CQL4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl20Q9CQL4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl20Q9CQL4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms