Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Med30Q9CQI9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Med30Q9CQI9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Med30Q9CQI9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Med30Q9CQI9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Med30Q9CQI9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Med30Q9CQI9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Med30Q9CQI9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Med30Q9CQI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Med30Q9CQI9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Med30Q9CQI9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med30Q9CQI9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med30Q9CQI9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Med30Q9CQI9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Med30Q9CQI9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med30Q9CQI9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med30Q9CQI9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Med30Q9CQI9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Med30Q9CQI9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Med30Q9CQI9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Med30Q9CQI9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Med30Q9CQI9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Med30Q9CQI9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Med30Q9CQI9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Med30Q9CQI9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Med30Q9CQI9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Med30Q9CQI9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Med30Q9CQI9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med30Q9CQI9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Med30Q9CQI9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med30Q9CQI9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med30Q9CQI9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med30Q9CQI9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Med30Q9CQI9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Med30Q9CQI9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Med30Q9CQI9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med30Q9CQI9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med30Q9CQI9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Med30Q9CQI9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med30Q9CQI9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Med30Q9CQI9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Med30Q9CQI9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Med30Q9CQI9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Med30Q9CQI9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Med30Q9CQI9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Med30Q9CQI9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Med30Q9CQI9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med30Q9CQI9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med30Q9CQI9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med30Q9CQI9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med30Q9CQI9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Med30Q9CQI9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Med30Q9CQI9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med30Q9CQI9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med30Q9CQI9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Med30Q9CQI9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med30Q9CQI9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med30Q9CQI9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med30Q9CQI9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med30Q9CQI9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med30Q9CQI9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med30Q9CQI9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med30Q9CQI9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med30Q9CQI9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med30Q9CQI9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med30Q9CQI9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med30Q9CQI9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med30Q9CQI9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med30Q9CQI9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med30Q9CQI9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Med30Q9CQI9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med30Q9CQI9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med30Q9CQI9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Med30Q9CQI9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med30Q9CQI9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med30Q9CQI9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med30Q9CQI9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med30Q9CQI9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med30Q9CQI9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med30Q9CQI9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med30Q9CQI9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Med30Q9CQI9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med30Q9CQI9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med30Q9CQI9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med30Q9CQI9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med30Q9CQI9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms