Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ69

Uqcrq, Cytochrome b-c1 complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UqcrqQ9CQ69 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UqcrqQ9CQ69 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UqcrqQ9CQ69 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UqcrqQ9CQ69 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UqcrqQ9CQ69 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UqcrqQ9CQ69 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UqcrqQ9CQ69 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UqcrqQ9CQ69 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UqcrqQ9CQ69 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UqcrqQ9CQ69 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UqcrqQ9CQ69 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UqcrqQ9CQ69 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UqcrqQ9CQ69 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UqcrqQ9CQ69 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UqcrqQ9CQ69 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UqcrqQ9CQ69 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UqcrqQ9CQ69 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UqcrqQ9CQ69 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UqcrqQ9CQ69 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UqcrqQ9CQ69 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UqcrqQ9CQ69 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UqcrqQ9CQ69 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UqcrqQ9CQ69 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UqcrqQ9CQ69 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UqcrqQ9CQ69 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UqcrqQ9CQ69 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UqcrqQ9CQ69 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UqcrqQ9CQ69 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UqcrqQ9CQ69 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UqcrqQ9CQ69 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UqcrqQ9CQ69 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UqcrqQ9CQ69 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UqcrqQ9CQ69 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UqcrqQ9CQ69 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UqcrqQ9CQ69 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UqcrqQ9CQ69 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UqcrqQ9CQ69 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UqcrqQ9CQ69 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UqcrqQ9CQ69 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UqcrqQ9CQ69 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UqcrqQ9CQ69 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UqcrqQ9CQ69 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UqcrqQ9CQ69 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UqcrqQ9CQ69 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UqcrqQ9CQ69 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UqcrqQ9CQ69 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UqcrqQ9CQ69 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UqcrqQ9CQ69 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UqcrqQ9CQ69 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UqcrqQ9CQ69 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UqcrqQ9CQ69 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UqcrqQ9CQ69 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms