Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Commd4Q9CQ02 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Commd4Q9CQ02 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Commd4Q9CQ02 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Commd4Q9CQ02 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Commd4Q9CQ02 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Commd4Q9CQ02 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Commd4Q9CQ02 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Commd4Q9CQ02 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Commd4Q9CQ02 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Commd4Q9CQ02 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Commd4Q9CQ02 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,08■■□□□ 1,45
Commd4Q9CQ02 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Commd4Q9CQ02 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Commd4Q9CQ02 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Commd4Q9CQ02 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Commd4Q9CQ02 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Commd4Q9CQ02 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Commd4Q9CQ02 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Commd4Q9CQ02 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Commd4Q9CQ02 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Commd4Q9CQ02 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Commd4Q9CQ02 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Commd4Q9CQ02 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Commd4Q9CQ02 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Commd4Q9CQ02 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Commd4Q9CQ02 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Commd4Q9CQ02 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Commd4Q9CQ02 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,4
Commd4Q9CQ02 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Commd4Q9CQ02 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Commd4Q9CQ02 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Commd4Q9CQ02 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Commd4Q9CQ02 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Commd4Q9CQ02 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Commd4Q9CQ02 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Commd4Q9CQ02 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Commd4Q9CQ02 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,72■■□□□ 1,39
Commd4Q9CQ02 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Commd4Q9CQ02 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Commd4Q9CQ02 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Commd4Q9CQ02 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Commd4Q9CQ02 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Commd4Q9CQ02 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Commd4Q9CQ02 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Commd4Q9CQ02 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Commd4Q9CQ02 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Commd4Q9CQ02 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Commd4Q9CQ02 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Commd4Q9CQ02 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Commd4Q9CQ02 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Commd4Q9CQ02 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Commd4Q9CQ02 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Commd4Q9CQ02 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Commd4Q9CQ02 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Commd4Q9CQ02 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Commd4Q9CQ02 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Commd4Q9CQ02 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Commd4Q9CQ02 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Commd4Q9CQ02 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,33■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Commd4Q9CQ02 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Commd4Q9CQ02 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Commd4Q9CQ02 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Commd4Q9CQ02 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Commd4Q9CQ02 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Commd4Q9CQ02 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Commd4Q9CQ02 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Commd4Q9CQ02 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Commd4Q9CQ02 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Commd4Q9CQ02 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Commd4Q9CQ02 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Commd4Q9CQ02 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Commd4Q9CQ02 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Commd4Q9CQ02 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Commd4Q9CQ02 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
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