Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab27bQ99P58 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab27bQ99P58 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab27bQ99P58 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27bQ99P58 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27bQ99P58 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27bQ99P58 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27bQ99P58 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27bQ99P58 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27bQ99P58 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27bQ99P58 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab27bQ99P58 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab27bQ99P58 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab27bQ99P58 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab27bQ99P58 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab27bQ99P58 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab27bQ99P58 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab27bQ99P58 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab27bQ99P58 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab27bQ99P58 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab27bQ99P58 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab27bQ99P58 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab27bQ99P58 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab27bQ99P58 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab27bQ99P58 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab27bQ99P58 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab27bQ99P58 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab27bQ99P58 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab27bQ99P58 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab27bQ99P58 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab27bQ99P58 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab27bQ99P58 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab27bQ99P58 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab27bQ99P58 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab27bQ99P58 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab27bQ99P58 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab27bQ99P58 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab27bQ99P58 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab27bQ99P58 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab27bQ99P58 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab27bQ99P58 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab27bQ99P58 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab27bQ99P58 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab27bQ99P58 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab27bQ99P58 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab27bQ99P58 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab27bQ99P58 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab27bQ99P58 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab27bQ99P58 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab27bQ99P58 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rab27bQ99P58 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab27bQ99P58 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab27bQ99P58 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab27bQ99P58 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab27bQ99P58 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab27bQ99P58 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab27bQ99P58 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab27bQ99P58 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab27bQ99P58 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab27bQ99P58 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab27bQ99P58 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab27bQ99P58 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab27bQ99P58 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab27bQ99P58 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab27bQ99P58 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab27bQ99P58 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rab27bQ99P58 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab27bQ99P58 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab27bQ99P58 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab27bQ99P58 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab27bQ99P58 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab27bQ99P58 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab27bQ99P58 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab27bQ99P58 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms