Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH2

Pard3, Partitioning defective 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3Q99NH2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Pard3Q99NH2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Pard3Q99NH2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Pard3Q99NH2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pard3Q99NH2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pard3Q99NH2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Pard3Q99NH2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Pard3Q99NH2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Pard3Q99NH2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Pard3Q99NH2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Pard3Q99NH2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Pard3Q99NH2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Pard3Q99NH2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Pard3Q99NH2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pard3Q99NH2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pard3Q99NH2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pard3Q99NH2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Pard3Q99NH2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pard3Q99NH2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Pard3Q99NH2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pard3Q99NH2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pard3Q99NH2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pard3Q99NH2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pard3Q99NH2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pard3Q99NH2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pard3Q99NH2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Pard3Q99NH2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Pard3Q99NH2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pard3Q99NH2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pard3Q99NH2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pard3Q99NH2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Pard3Q99NH2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pard3Q99NH2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Pard3Q99NH2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pard3Q99NH2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Pard3Q99NH2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pard3Q99NH2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Pard3Q99NH2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pard3Q99NH2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pard3Q99NH2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Pard3Q99NH2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Pard3Q99NH2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pard3Q99NH2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pard3Q99NH2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pard3Q99NH2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pard3Q99NH2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pard3Q99NH2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pard3Q99NH2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Pard3Q99NH2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Pard3Q99NH2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pard3Q99NH2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pard3Q99NH2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pard3Q99NH2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pard3Q99NH2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pard3Q99NH2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pard3Q99NH2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pard3Q99NH2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pard3Q99NH2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pard3Q99NH2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pard3Q99NH2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pard3Q99NH2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pard3Q99NH2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pard3Q99NH2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pard3Q99NH2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Pard3Q99NH2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pard3Q99NH2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pard3Q99NH2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pard3Q99NH2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pard3Q99NH2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Pard3Q99NH2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pard3Q99NH2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pard3Q99NH2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pard3Q99NH2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Pard3Q99NH2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pard3Q99NH2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pard3Q99NH2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pard3Q99NH2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Pard3Q99NH2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pard3Q99NH2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pard3Q99NH2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pard3Q99NH2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pard3Q99NH2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pard3Q99NH2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pard3Q99NH2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pard3Q99NH2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pard3Q99NH2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pard3Q99NH2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Pard3Q99NH2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Pard3Q99NH2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pard3Q99NH2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Pard3Q99NH2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pard3Q99NH2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms