Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF8

Ranbp17, Ran-binding protein 17, mousemouse

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Length 1,088 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp17Q99NF8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Ranbp17Q99NF8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Ranbp17Q99NF8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Ranbp17Q99NF8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Ranbp17Q99NF8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Ranbp17Q99NF8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Ranbp17Q99NF8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Ranbp17Q99NF8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Ranbp17Q99NF8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Ranbp17Q99NF8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Ranbp17Q99NF8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Ranbp17Q99NF8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Ranbp17Q99NF8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Ranbp17Q99NF8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Ranbp17Q99NF8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Ranbp17Q99NF8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Ranbp17Q99NF8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Ranbp17Q99NF8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Ranbp17Q99NF8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Ranbp17Q99NF8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Ranbp17Q99NF8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Ranbp17Q99NF8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Ranbp17Q99NF8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ranbp17Q99NF8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ranbp17Q99NF8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ranbp17Q99NF8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ranbp17Q99NF8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ranbp17Q99NF8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ranbp17Q99NF8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Ranbp17Q99NF8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Ranbp17Q99NF8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ranbp17Q99NF8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Ranbp17Q99NF8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Ranbp17Q99NF8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Ranbp17Q99NF8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Ranbp17Q99NF8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ranbp17Q99NF8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Ranbp17Q99NF8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ranbp17Q99NF8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Ranbp17Q99NF8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ranbp17Q99NF8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Ranbp17Q99NF8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Ranbp17Q99NF8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ranbp17Q99NF8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ranbp17Q99NF8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ranbp17Q99NF8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ranbp17Q99NF8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Ranbp17Q99NF8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ranbp17Q99NF8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ranbp17Q99NF8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ranbp17Q99NF8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ranbp17Q99NF8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ranbp17Q99NF8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Ranbp17Q99NF8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ranbp17Q99NF8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ranbp17Q99NF8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ranbp17Q99NF8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Ranbp17Q99NF8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,4
Ranbp17Q99NF8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ranbp17Q99NF8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ranbp17Q99NF8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ranbp17Q99NF8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ranbp17Q99NF8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Ranbp17Q99NF8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ranbp17Q99NF8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ranbp17Q99NF8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ranbp17Q99NF8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ranbp17Q99NF8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ranbp17Q99NF8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ranbp17Q99NF8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ranbp17Q99NF8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ranbp17Q99NF8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ranbp17Q99NF8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ranbp17Q99NF8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Ranbp17Q99NF8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ranbp17Q99NF8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ranbp17Q99NF8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ranbp17Q99NF8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ranbp17Q99NF8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ranbp17Q99NF8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ranbp17Q99NF8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ranbp17Q99NF8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ranbp17Q99NF8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ranbp17Q99NF8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ranbp17Q99NF8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ranbp17Q99NF8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ranbp17Q99NF8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ranbp17Q99NF8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ranbp17Q99NF8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ranbp17Q99NF8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ranbp17Q99NF8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ranbp17Q99NF8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,2 ms