Protein–RNA interactions for Protein: Q99N48

Sytl3, Synaptotagmin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sytl3Q99N48 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sytl3Q99N48 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sytl3Q99N48 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sytl3Q99N48 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sytl3Q99N48 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sytl3Q99N48 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sytl3Q99N48 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sytl3Q99N48 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sytl3Q99N48 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sytl3Q99N48 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sytl3Q99N48 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sytl3Q99N48 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sytl3Q99N48 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sytl3Q99N48 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sytl3Q99N48 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sytl3Q99N48 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sytl3Q99N48 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sytl3Q99N48 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sytl3Q99N48 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sytl3Q99N48 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sytl3Q99N48 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sytl3Q99N48 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sytl3Q99N48 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sytl3Q99N48 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sytl3Q99N48 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sytl3Q99N48 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sytl3Q99N48 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sytl3Q99N48 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sytl3Q99N48 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sytl3Q99N48 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sytl3Q99N48 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sytl3Q99N48 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sytl3Q99N48 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sytl3Q99N48 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sytl3Q99N48 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sytl3Q99N48 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sytl3Q99N48 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sytl3Q99N48 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sytl3Q99N48 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sytl3Q99N48 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sytl3Q99N48 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sytl3Q99N48 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sytl3Q99N48 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sytl3Q99N48 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sytl3Q99N48 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sytl3Q99N48 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sytl3Q99N48 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sytl3Q99N48 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sytl3Q99N48 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sytl3Q99N48 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sytl3Q99N48 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sytl3Q99N48 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sytl3Q99N48 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sytl3Q99N48 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sytl3Q99N48 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sytl3Q99N48 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sytl3Q99N48 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sytl3Q99N48 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sytl3Q99N48 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sytl3Q99N48 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sytl3Q99N48 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sytl3Q99N48 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sytl3Q99N48 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sytl3Q99N48 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sytl3Q99N48 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sytl3Q99N48 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sytl3Q99N48 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sytl3Q99N48 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sytl3Q99N48 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sytl3Q99N48 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sytl3Q99N48 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sytl3Q99N48 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sytl3Q99N48 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sytl3Q99N48 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sytl3Q99N48 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sytl3Q99N48 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sytl3Q99N48 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sytl3Q99N48 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sytl3Q99N48 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sytl3Q99N48 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sytl3Q99N48 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sytl3Q99N48 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sytl3Q99N48 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms