Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rassf1Q99MK9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rassf1Q99MK9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rassf1Q99MK9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rassf1Q99MK9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rassf1Q99MK9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rassf1Q99MK9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rassf1Q99MK9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rassf1Q99MK9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rassf1Q99MK9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rassf1Q99MK9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rassf1Q99MK9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rassf1Q99MK9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rassf1Q99MK9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rassf1Q99MK9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rassf1Q99MK9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rassf1Q99MK9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rassf1Q99MK9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rassf1Q99MK9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rassf1Q99MK9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rassf1Q99MK9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rassf1Q99MK9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rassf1Q99MK9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf1Q99MK9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf1Q99MK9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf1Q99MK9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rassf1Q99MK9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf1Q99MK9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf1Q99MK9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rassf1Q99MK9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rassf1Q99MK9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rassf1Q99MK9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rassf1Q99MK9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rassf1Q99MK9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rassf1Q99MK9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rassf1Q99MK9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rassf1Q99MK9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rassf1Q99MK9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rassf1Q99MK9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf1Q99MK9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf1Q99MK9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf1Q99MK9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rassf1Q99MK9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rassf1Q99MK9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rassf1Q99MK9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf1Q99MK9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf1Q99MK9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rassf1Q99MK9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf1Q99MK9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf1Q99MK9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf1Q99MK9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rassf1Q99MK9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rassf1Q99MK9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rassf1Q99MK9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rassf1Q99MK9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rassf1Q99MK9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rassf1Q99MK9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rassf1Q99MK9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rassf1Q99MK9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rassf1Q99MK9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rassf1Q99MK9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rassf1Q99MK9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rassf1Q99MK9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rassf1Q99MK9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rassf1Q99MK9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rassf1Q99MK9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rassf1Q99MK9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rassf1Q99MK9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rassf1Q99MK9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rassf1Q99MK9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rassf1Q99MK9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rassf1Q99MK9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rassf1Q99MK9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rassf1Q99MK9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rassf1Q99MK9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rassf1Q99MK9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rassf1Q99MK9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rassf1Q99MK9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rassf1Q99MK9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202 ms