Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pls3Q99K51 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pls3Q99K51 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pls3Q99K51 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pls3Q99K51 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pls3Q99K51 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pls3Q99K51 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pls3Q99K51 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pls3Q99K51 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pls3Q99K51 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pls3Q99K51 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pls3Q99K51 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pls3Q99K51 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pls3Q99K51 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pls3Q99K51 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pls3Q99K51 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pls3Q99K51 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pls3Q99K51 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pls3Q99K51 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Pls3Q99K51 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pls3Q99K51 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pls3Q99K51 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pls3Q99K51 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pls3Q99K51 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pls3Q99K51 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pls3Q99K51 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pls3Q99K51 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pls3Q99K51 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pls3Q99K51 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pls3Q99K51 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pls3Q99K51 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pls3Q99K51 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pls3Q99K51 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pls3Q99K51 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pls3Q99K51 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Pls3Q99K51 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Pls3Q99K51 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Pls3Q99K51 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pls3Q99K51 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pls3Q99K51 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pls3Q99K51 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pls3Q99K51 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pls3Q99K51 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pls3Q99K51 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Pls3Q99K51 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pls3Q99K51 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pls3Q99K51 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pls3Q99K51 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pls3Q99K51 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pls3Q99K51 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pls3Q99K51 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pls3Q99K51 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pls3Q99K51 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pls3Q99K51 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pls3Q99K51 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pls3Q99K51 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pls3Q99K51 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pls3Q99K51 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pls3Q99K51 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pls3Q99K51 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pls3Q99K51 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pls3Q99K51 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pls3Q99K51 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pls3Q99K51 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Pls3Q99K51 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pls3Q99K51 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pls3Q99K51 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pls3Q99K51 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pls3Q99K51 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pls3Q99K51 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Pls3Q99K51 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pls3Q99K51 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pls3Q99K51 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pls3Q99K51 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pls3Q99K51 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pls3Q99K51 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pls3Q99K51 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pls3Q99K51 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pls3Q99K51 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pls3Q99K51 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pls3Q99K51 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pls3Q99K51 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pls3Q99K51 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pls3Q99K51 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pls3Q99K51 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pls3Q99K51 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pls3Q99K51 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pls3Q99K51 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pls3Q99K51 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pls3Q99K51 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pls3Q99K51 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms