Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufsp2Q99K23 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufsp2Q99K23 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ufsp2Q99K23 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufsp2Q99K23 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufsp2Q99K23 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufsp2Q99K23 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ufsp2Q99K23 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufsp2Q99K23 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufsp2Q99K23 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufsp2Q99K23 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufsp2Q99K23 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufsp2Q99K23 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufsp2Q99K23 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufsp2Q99K23 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufsp2Q99K23 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ufsp2Q99K23 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ufsp2Q99K23 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufsp2Q99K23 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufsp2Q99K23 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufsp2Q99K23 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufsp2Q99K23 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufsp2Q99K23 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ufsp2Q99K23 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufsp2Q99K23 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufsp2Q99K23 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ufsp2Q99K23 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ufsp2Q99K23 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ufsp2Q99K23 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ufsp2Q99K23 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufsp2Q99K23 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufsp2Q99K23 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ufsp2Q99K23 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ufsp2Q99K23 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ufsp2Q99K23 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufsp2Q99K23 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufsp2Q99K23 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufsp2Q99K23 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufsp2Q99K23 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufsp2Q99K23 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufsp2Q99K23 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufsp2Q99K23 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufsp2Q99K23 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufsp2Q99K23 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufsp2Q99K23 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ufsp2Q99K23 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ufsp2Q99K23 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufsp2Q99K23 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ufsp2Q99K23 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufsp2Q99K23 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufsp2Q99K23 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufsp2Q99K23 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufsp2Q99K23 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufsp2Q99K23 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms