Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
EpcamQ99JW5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
EpcamQ99JW5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
EpcamQ99JW5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,2■□□□□ 0,98
EpcamQ99JW5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
EpcamQ99JW5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
EpcamQ99JW5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
EpcamQ99JW5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
EpcamQ99JW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,11■□□□□ 0,97
EpcamQ99JW5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
EpcamQ99JW5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
EpcamQ99JW5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,08■□□□□ 0,97
EpcamQ99JW5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
EpcamQ99JW5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
EpcamQ99JW5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
EpcamQ99JW5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
EpcamQ99JW5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
EpcamQ99JW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
EpcamQ99JW5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
EpcamQ99JW5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
EpcamQ99JW5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,96■□□□□ 0,95
EpcamQ99JW5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
EpcamQ99JW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
EpcamQ99JW5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
EpcamQ99JW5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
EpcamQ99JW5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
EpcamQ99JW5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
EpcamQ99JW5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
EpcamQ99JW5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
EpcamQ99JW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
EpcamQ99JW5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
EpcamQ99JW5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,88■□□□□ 0,93
EpcamQ99JW5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
EpcamQ99JW5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
EpcamQ99JW5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
EpcamQ99JW5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
EpcamQ99JW5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
EpcamQ99JW5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
EpcamQ99JW5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
EpcamQ99JW5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,79■□□□□ 0,92
EpcamQ99JW5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
EpcamQ99JW5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
EpcamQ99JW5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
EpcamQ99JW5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,76■□□□□ 0,91
EpcamQ99JW5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
EpcamQ99JW5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
EpcamQ99JW5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
EpcamQ99JW5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
EpcamQ99JW5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
EpcamQ99JW5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
EpcamQ99JW5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20,71■□□□□ 0,91
EpcamQ99JW5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
EpcamQ99JW5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
EpcamQ99JW5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
EpcamQ99JW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
EpcamQ99JW5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
EpcamQ99JW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
EpcamQ99JW5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
EpcamQ99JW5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
EpcamQ99JW5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,6■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
EpcamQ99JW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,58■□□□□ 0,88
EpcamQ99JW5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
EpcamQ99JW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
EpcamQ99JW5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20,56■□□□□ 0,88
EpcamQ99JW5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
EpcamQ99JW5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20,54■□□□□ 0,88
EpcamQ99JW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
EpcamQ99JW5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
EpcamQ99JW5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20,49■□□□□ 0,87
EpcamQ99JW5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
EpcamQ99JW5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
EpcamQ99JW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
EpcamQ99JW5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
EpcamQ99JW5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
EpcamQ99JW5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
EpcamQ99JW5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20,46■□□□□ 0,87
EpcamQ99JW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
EpcamQ99JW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
EpcamQ99JW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
EpcamQ99JW5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
EpcamQ99JW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
EpcamQ99JW5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
EpcamQ99JW5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
EpcamQ99JW5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
EpcamQ99JW5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
EpcamQ99JW5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
EpcamQ99JW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
EpcamQ99JW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
EpcamQ99JW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
EpcamQ99JW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
EpcamQ99JW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,7 ms