Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddb2Q99J79 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddb2Q99J79 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddb2Q99J79 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddb2Q99J79 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddb2Q99J79 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddb2Q99J79 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddb2Q99J79 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddb2Q99J79 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddb2Q99J79 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddb2Q99J79 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddb2Q99J79 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddb2Q99J79 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddb2Q99J79 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddb2Q99J79 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddb2Q99J79 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddb2Q99J79 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddb2Q99J79 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb2Q99J79 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddb2Q99J79 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb2Q99J79 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb2Q99J79 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddb2Q99J79 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddb2Q99J79 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddb2Q99J79 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddb2Q99J79 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddb2Q99J79 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddb2Q99J79 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddb2Q99J79 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddb2Q99J79 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddb2Q99J79 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddb2Q99J79 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddb2Q99J79 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddb2Q99J79 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddb2Q99J79 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddb2Q99J79 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddb2Q99J79 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddb2Q99J79 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddb2Q99J79 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddb2Q99J79 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddb2Q99J79 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddb2Q99J79 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddb2Q99J79 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddb2Q99J79 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddb2Q99J79 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddb2Q99J79 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddb2Q99J79 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddb2Q99J79 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddb2Q99J79 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddb2Q99J79 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddb2Q99J79 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddb2Q99J79 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddb2Q99J79 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddb2Q99J79 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddb2Q99J79 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddb2Q99J79 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddb2Q99J79 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddb2Q99J79 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddb2Q99J79 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddb2Q99J79 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddb2Q99J79 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddb2Q99J79 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddb2Q99J79 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddb2Q99J79 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddb2Q99J79 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddb2Q99J79 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddb2Q99J79 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddb2Q99J79 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddb2Q99J79 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddb2Q99J79 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddb2Q99J79 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddb2Q99J79 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddb2Q99J79 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddb2Q99J79 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddb2Q99J79 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddb2Q99J79 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddb2Q99J79 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddb2Q99J79 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddb2Q99J79 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddb2Q99J79 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddb2Q99J79 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddb2Q99J79 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddb2Q99J79 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddb2Q99J79 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddb2Q99J79 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddb2Q99J79 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddb2Q99J79 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddb2Q99J79 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddb2Q99J79 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddb2Q99J79 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddb2Q99J79 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddb2Q99J79 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms