Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc33a1Q99J27 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc33a1Q99J27 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc33a1Q99J27 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc33a1Q99J27 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc33a1Q99J27 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc33a1Q99J27 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc33a1Q99J27 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc33a1Q99J27 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc33a1Q99J27 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc33a1Q99J27 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc33a1Q99J27 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc33a1Q99J27 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc33a1Q99J27 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc33a1Q99J27 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc33a1Q99J27 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc33a1Q99J27 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc33a1Q99J27 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc33a1Q99J27 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc33a1Q99J27 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc33a1Q99J27 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc33a1Q99J27 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc33a1Q99J27 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc33a1Q99J27 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc33a1Q99J27 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc33a1Q99J27 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc33a1Q99J27 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc33a1Q99J27 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc33a1Q99J27 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc33a1Q99J27 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc33a1Q99J27 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc33a1Q99J27 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc33a1Q99J27 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc33a1Q99J27 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc33a1Q99J27 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc33a1Q99J27 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc33a1Q99J27 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc33a1Q99J27 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc33a1Q99J27 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc33a1Q99J27 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc33a1Q99J27 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc33a1Q99J27 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc33a1Q99J27 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc33a1Q99J27 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc33a1Q99J27 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc33a1Q99J27 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc33a1Q99J27 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc33a1Q99J27 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc33a1Q99J27 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc33a1Q99J27 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc33a1Q99J27 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc33a1Q99J27 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc33a1Q99J27 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc33a1Q99J27 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc33a1Q99J27 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc33a1Q99J27 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc33a1Q99J27 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc33a1Q99J27 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc33a1Q99J27 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc33a1Q99J27 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc33a1Q99J27 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc33a1Q99J27 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc33a1Q99J27 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc33a1Q99J27 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc33a1Q99J27 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc33a1Q99J27 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc33a1Q99J27 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc33a1Q99J27 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc33a1Q99J27 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc33a1Q99J27 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc33a1Q99J27 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc33a1Q99J27 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc33a1Q99J27 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc33a1Q99J27 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc33a1Q99J27 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc33a1Q99J27 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc33a1Q99J27 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc33a1Q99J27 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc33a1Q99J27 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc33a1Q99J27 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc33a1Q99J27 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc33a1Q99J27 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc33a1Q99J27 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc33a1Q99J27 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc33a1Q99J27 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc33a1Q99J27 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc33a1Q99J27 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc33a1Q99J27 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc33a1Q99J27 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc33a1Q99J27 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc33a1Q99J27 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms