Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn16Q925N4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn16Q925N4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn16Q925N4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn16Q925N4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn16Q925N4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn16Q925N4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn16Q925N4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn16Q925N4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn16Q925N4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn16Q925N4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn16Q925N4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn16Q925N4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn16Q925N4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn16Q925N4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn16Q925N4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn16Q925N4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn16Q925N4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn16Q925N4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn16Q925N4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn16Q925N4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn16Q925N4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn16Q925N4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn16Q925N4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn16Q925N4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn16Q925N4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn16Q925N4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn16Q925N4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn16Q925N4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn16Q925N4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn16Q925N4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn16Q925N4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn16Q925N4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn16Q925N4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn16Q925N4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn16Q925N4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn16Q925N4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn16Q925N4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn16Q925N4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn16Q925N4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn16Q925N4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn16Q925N4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn16Q925N4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn16Q925N4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn16Q925N4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn16Q925N4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn16Q925N4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn16Q925N4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn16Q925N4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn16Q925N4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn16Q925N4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn16Q925N4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn16Q925N4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn16Q925N4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn16Q925N4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn16Q925N4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn16Q925N4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn16Q925N4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn16Q925N4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn16Q925N4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn16Q925N4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn16Q925N4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn16Q925N4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn16Q925N4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn16Q925N4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn16Q925N4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn16Q925N4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn16Q925N4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn16Q925N4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn16Q925N4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn16Q925N4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn16Q925N4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn16Q925N4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn16Q925N4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms