Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf144aQ925F3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnf144aQ925F3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rnf144aQ925F3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rnf144aQ925F3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rnf144aQ925F3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rnf144aQ925F3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rnf144aQ925F3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf144aQ925F3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf144aQ925F3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf144aQ925F3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf144aQ925F3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf144aQ925F3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf144aQ925F3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf144aQ925F3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf144aQ925F3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf144aQ925F3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf144aQ925F3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf144aQ925F3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf144aQ925F3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf144aQ925F3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf144aQ925F3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf144aQ925F3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf144aQ925F3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf144aQ925F3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf144aQ925F3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf144aQ925F3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf144aQ925F3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf144aQ925F3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf144aQ925F3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf144aQ925F3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf144aQ925F3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf144aQ925F3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf144aQ925F3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf144aQ925F3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf144aQ925F3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf144aQ925F3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf144aQ925F3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf144aQ925F3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf144aQ925F3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf144aQ925F3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf144aQ925F3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf144aQ925F3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf144aQ925F3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rnf144aQ925F3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf144aQ925F3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf144aQ925F3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf144aQ925F3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf144aQ925F3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf144aQ925F3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rnf144aQ925F3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf144aQ925F3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf144aQ925F3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf144aQ925F3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf144aQ925F3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf144aQ925F3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf144aQ925F3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf144aQ925F3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf144aQ925F3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf144aQ925F3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf144aQ925F3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf144aQ925F3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf144aQ925F3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf144aQ925F3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf144aQ925F3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf144aQ925F3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf144aQ925F3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf144aQ925F3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf144aQ925F3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf144aQ925F3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf144aQ925F3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf144aQ925F3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf144aQ925F3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf144aQ925F3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf144aQ925F3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf144aQ925F3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf144aQ925F3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf144aQ925F3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf144aQ925F3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf144aQ925F3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf144aQ925F3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf144aQ925F3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf144aQ925F3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf144aQ925F3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf144aQ925F3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf144aQ925F3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf144aQ925F3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf144aQ925F3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf144aQ925F3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf144aQ925F3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf144aQ925F3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf144aQ925F3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf144aQ925F3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf144aQ925F3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf144aQ925F3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf144aQ925F3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms