Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ferd3lQ923Z4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ferd3lQ923Z4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ferd3lQ923Z4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ferd3lQ923Z4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ferd3lQ923Z4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ferd3lQ923Z4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ferd3lQ923Z4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ferd3lQ923Z4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ferd3lQ923Z4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ferd3lQ923Z4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ferd3lQ923Z4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ferd3lQ923Z4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ferd3lQ923Z4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ferd3lQ923Z4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ferd3lQ923Z4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ferd3lQ923Z4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ferd3lQ923Z4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Ferd3lQ923Z4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ferd3lQ923Z4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ferd3lQ923Z4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ferd3lQ923Z4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ferd3lQ923Z4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ferd3lQ923Z4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ferd3lQ923Z4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Ferd3lQ923Z4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ferd3lQ923Z4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Ferd3lQ923Z4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ferd3lQ923Z4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ferd3lQ923Z4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ferd3lQ923Z4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ferd3lQ923Z4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,08■■□□□ 1,92
Ferd3lQ923Z4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ferd3lQ923Z4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Ferd3lQ923Z4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Ferd3lQ923Z4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ferd3lQ923Z4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ferd3lQ923Z4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ferd3lQ923Z4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ferd3lQ923Z4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ferd3lQ923Z4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ferd3lQ923Z4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ferd3lQ923Z4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ferd3lQ923Z4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Ferd3lQ923Z4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ferd3lQ923Z4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ferd3lQ923Z4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ferd3lQ923Z4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ferd3lQ923Z4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ferd3lQ923Z4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Ferd3lQ923Z4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ferd3lQ923Z4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ferd3lQ923Z4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ferd3lQ923Z4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ferd3lQ923Z4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ferd3lQ923Z4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ferd3lQ923Z4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Ferd3lQ923Z4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ferd3lQ923Z4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ferd3lQ923Z4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ferd3lQ923Z4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ferd3lQ923Z4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ferd3lQ923Z4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ferd3lQ923Z4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ferd3lQ923Z4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ferd3lQ923Z4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ferd3lQ923Z4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Ferd3lQ923Z4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ferd3lQ923Z4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ferd3lQ923Z4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Ferd3lQ923Z4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ferd3lQ923Z4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ferd3lQ923Z4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Ferd3lQ923Z4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Ferd3lQ923Z4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ferd3lQ923Z4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ferd3lQ923Z4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ferd3lQ923Z4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ferd3lQ923Z4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ferd3lQ923Z4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ferd3lQ923Z4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ferd3lQ923Z4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ferd3lQ923Z4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ferd3lQ923Z4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ferd3lQ923Z4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ferd3lQ923Z4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Ferd3lQ923Z4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ferd3lQ923Z4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ferd3lQ923Z4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ferd3lQ923Z4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ferd3lQ923Z4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Ferd3lQ923Z4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,6 ms