Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Ubxn1Q922Y1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ubxn1Q922Y1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ubxn1Q922Y1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ubxn1Q922Y1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ubxn1Q922Y1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Ubxn1Q922Y1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ubxn1Q922Y1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ubxn1Q922Y1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ubxn1Q922Y1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Ubxn1Q922Y1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ubxn1Q922Y1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ubxn1Q922Y1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ubxn1Q922Y1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ubxn1Q922Y1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ubxn1Q922Y1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ubxn1Q922Y1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Ubxn1Q922Y1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ubxn1Q922Y1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ubxn1Q922Y1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ubxn1Q922Y1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ubxn1Q922Y1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ubxn1Q922Y1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ubxn1Q922Y1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ubxn1Q922Y1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ubxn1Q922Y1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ubxn1Q922Y1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ubxn1Q922Y1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ubxn1Q922Y1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ubxn1Q922Y1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ubxn1Q922Y1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ubxn1Q922Y1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ubxn1Q922Y1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Ubxn1Q922Y1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ubxn1Q922Y1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ubxn1Q922Y1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ubxn1Q922Y1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Ubxn1Q922Y1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ubxn1Q922Y1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Ubxn1Q922Y1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ubxn1Q922Y1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ubxn1Q922Y1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ubxn1Q922Y1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Ubxn1Q922Y1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ubxn1Q922Y1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ubxn1Q922Y1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Ubxn1Q922Y1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ubxn1Q922Y1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ubxn1Q922Y1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ubxn1Q922Y1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Ubxn1Q922Y1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ubxn1Q922Y1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ubxn1Q922Y1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ubxn1Q922Y1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ubxn1Q922Y1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ubxn1Q922Y1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ubxn1Q922Y1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ubxn1Q922Y1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ubxn1Q922Y1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Ubxn1Q922Y1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ubxn1Q922Y1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ubxn1Q922Y1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ubxn1Q922Y1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ubxn1Q922Y1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ubxn1Q922Y1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ubxn1Q922Y1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ubxn1Q922Y1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Ubxn1Q922Y1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ubxn1Q922Y1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ubxn1Q922Y1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ubxn1Q922Y1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ubxn1Q922Y1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Ubxn1Q922Y1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ubxn1Q922Y1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ubxn1Q922Y1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ubxn1Q922Y1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Ubxn1Q922Y1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ubxn1Q922Y1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ubxn1Q922Y1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ubxn1Q922Y1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ubxn1Q922Y1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ubxn1Q922Y1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ubxn1Q922Y1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ubxn1Q922Y1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ubxn1Q922Y1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ubxn1Q922Y1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ubxn1Q922Y1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ubxn1Q922Y1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ubxn1Q922Y1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ubxn1Q922Y1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ubxn1Q922Y1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ubxn1Q922Y1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ubxn1Q922Y1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Ubxn1Q922Y1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ubxn1Q922Y1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ubxn1Q922Y1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ubxn1Q922Y1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Ubxn1Q922Y1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,55■■■□□ 2
Ubxn1Q922Y1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,54■■■□□ 2
Ubxn1Q922Y1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms