Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Klhdc4Q921I2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Klhdc4Q921I2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Klhdc4Q921I2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Klhdc4Q921I2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Klhdc4Q921I2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Klhdc4Q921I2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Klhdc4Q921I2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Klhdc4Q921I2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3,35
Klhdc4Q921I2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Klhdc4Q921I2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Klhdc4Q921I2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Klhdc4Q921I2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Klhdc4Q921I2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Klhdc4Q921I2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Klhdc4Q921I2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Klhdc4Q921I2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Klhdc4Q921I2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Klhdc4Q921I2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Klhdc4Q921I2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Klhdc4Q921I2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Klhdc4Q921I2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Klhdc4Q921I2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Klhdc4Q921I2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Klhdc4Q921I2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Klhdc4Q921I2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Klhdc4Q921I2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Klhdc4Q921I2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Klhdc4Q921I2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,61■■■■□ 3,29
Klhdc4Q921I2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Klhdc4Q921I2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Klhdc4Q921I2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Klhdc4Q921I2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,49■■■■□ 3,27
Klhdc4Q921I2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Klhdc4Q921I2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Klhdc4Q921I2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Klhdc4Q921I2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Klhdc4Q921I2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Klhdc4Q921I2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,31■■■■□ 3,24
Klhdc4Q921I2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Klhdc4Q921I2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Klhdc4Q921I2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Klhdc4Q921I2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Klhdc4Q921I2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Klhdc4Q921I2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
Klhdc4Q921I2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Klhdc4Q921I2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Klhdc4Q921I2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Klhdc4Q921I2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Klhdc4Q921I2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Klhdc4Q921I2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Klhdc4Q921I2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
Klhdc4Q921I2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Klhdc4Q921I2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Klhdc4Q921I2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Klhdc4Q921I2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3,19
Klhdc4Q921I2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Klhdc4Q921I2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Klhdc4Q921I2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Klhdc4Q921I2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Klhdc4Q921I2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Klhdc4Q921I2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Klhdc4Q921I2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Klhdc4Q921I2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Klhdc4Q921I2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Klhdc4Q921I2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Klhdc4Q921I2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
Klhdc4Q921I2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Klhdc4Q921I2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Klhdc4Q921I2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Klhdc4Q921I2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Klhdc4Q921I2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Klhdc4Q921I2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,62■■■■□ 3,13
Klhdc4Q921I2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Klhdc4Q921I2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Klhdc4Q921I2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Klhdc4Q921I2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Klhdc4Q921I2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,13
Klhdc4Q921I2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Klhdc4Q921I2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Klhdc4Q921I2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Klhdc4Q921I2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Klhdc4Q921I2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Klhdc4Q921I2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Klhdc4Q921I2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Klhdc4Q921I2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Klhdc4Q921I2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Klhdc4Q921I2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Klhdc4Q921I2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Klhdc4Q921I2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Klhdc4Q921I2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Klhdc4Q921I2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Klhdc4Q921I2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Klhdc4Q921I2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Klhdc4Q921I2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,36■■■■□ 3,09
Klhdc4Q921I2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Klhdc4Q921I2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Klhdc4Q921I2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Klhdc4Q921I2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Klhdc4Q921I2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms