Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y16

Pcdha3, Protocadherin alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha3Q91Y16 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdha3Q91Y16 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdha3Q91Y16 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcdha3Q91Y16 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdha3Q91Y16 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcdha3Q91Y16 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdha3Q91Y16 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdha3Q91Y16 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdha3Q91Y16 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdha3Q91Y16 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdha3Q91Y16 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcdha3Q91Y16 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdha3Q91Y16 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdha3Q91Y16 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdha3Q91Y16 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pcdha3Q91Y16 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcdha3Q91Y16 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcdha3Q91Y16 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcdha3Q91Y16 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pcdha3Q91Y16 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcdha3Q91Y16 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcdha3Q91Y16 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcdha3Q91Y16 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcdha3Q91Y16 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcdha3Q91Y16 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcdha3Q91Y16 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdha3Q91Y16 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdha3Q91Y16 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdha3Q91Y16 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pcdha3Q91Y16 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcdha3Q91Y16 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdha3Q91Y16 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdha3Q91Y16 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcdha3Q91Y16 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcdha3Q91Y16 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcdha3Q91Y16 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcdha3Q91Y16 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcdha3Q91Y16 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcdha3Q91Y16 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcdha3Q91Y16 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcdha3Q91Y16 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcdha3Q91Y16 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcdha3Q91Y16 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcdha3Q91Y16 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcdha3Q91Y16 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcdha3Q91Y16 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcdha3Q91Y16 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcdha3Q91Y16 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdha3Q91Y16 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdha3Q91Y16 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcdha3Q91Y16 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pcdha3Q91Y16 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcdha3Q91Y16 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcdha3Q91Y16 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcdha3Q91Y16 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcdha3Q91Y16 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcdha3Q91Y16 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdha3Q91Y16 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdha3Q91Y16 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pcdha3Q91Y16 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdha3Q91Y16 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdha3Q91Y16 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdha3Q91Y16 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdha3Q91Y16 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdha3Q91Y16 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdha3Q91Y16 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcdha3Q91Y16 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcdha3Q91Y16 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcdha3Q91Y16 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcdha3Q91Y16 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcdha3Q91Y16 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcdha3Q91Y16 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcdha3Q91Y16 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcdha3Q91Y16 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcdha3Q91Y16 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcdha3Q91Y16 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcdha3Q91Y16 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcdha3Q91Y16 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcdha3Q91Y16 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcdha3Q91Y16 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcdha3Q91Y16 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcdha3Q91Y16 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcdha3Q91Y16 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcdha3Q91Y16 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcdha3Q91Y16 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcdha3Q91Y16 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcdha3Q91Y16 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcdha3Q91Y16 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcdha3Q91Y16 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcdha3Q91Y16 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcdha3Q91Y16 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcdha3Q91Y16 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcdha3Q91Y16 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcdha3Q91Y16 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcdha3Q91Y16 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Pcdha3Q91Y16 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcdha3Q91Y16 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcdha3Q91Y16 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcdha3Q91Y16 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcdha3Q91Y16 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms