Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Mtmr4Q91XS1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Mtmr4Q91XS1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Mtmr4Q91XS1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Mtmr4Q91XS1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Mtmr4Q91XS1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Mtmr4Q91XS1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Mtmr4Q91XS1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Mtmr4Q91XS1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Mtmr4Q91XS1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Mtmr4Q91XS1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Mtmr4Q91XS1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Mtmr4Q91XS1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Mtmr4Q91XS1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Mtmr4Q91XS1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Mtmr4Q91XS1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Mtmr4Q91XS1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Mtmr4Q91XS1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Mtmr4Q91XS1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Mtmr4Q91XS1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Mtmr4Q91XS1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Mtmr4Q91XS1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Mtmr4Q91XS1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Mtmr4Q91XS1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Mtmr4Q91XS1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Mtmr4Q91XS1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Mtmr4Q91XS1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,06■■■□□ 2,72
Mtmr4Q91XS1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,03■■■□□ 2,72
Mtmr4Q91XS1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Mtmr4Q91XS1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Mtmr4Q91XS1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Mtmr4Q91XS1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Mtmr4Q91XS1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Mtmr4Q91XS1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Mtmr4Q91XS1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Mtmr4Q91XS1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Mtmr4Q91XS1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Mtmr4Q91XS1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Mtmr4Q91XS1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Mtmr4Q91XS1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Mtmr4Q91XS1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Mtmr4Q91XS1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Mtmr4Q91XS1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Mtmr4Q91XS1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,69■■■□□ 2,66
Mtmr4Q91XS1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
Mtmr4Q91XS1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Mtmr4Q91XS1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Mtmr4Q91XS1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Mtmr4Q91XS1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Mtmr4Q91XS1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Mtmr4Q91XS1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Mtmr4Q91XS1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Mtmr4Q91XS1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,54■■■□□ 2,64
Mtmr4Q91XS1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Mtmr4Q91XS1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Mtmr4Q91XS1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Mtmr4Q91XS1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Mtmr4Q91XS1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Mtmr4Q91XS1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Mtmr4Q91XS1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Mtmr4Q91XS1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Mtmr4Q91XS1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Mtmr4Q91XS1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Mtmr4Q91XS1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Mtmr4Q91XS1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Mtmr4Q91XS1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Mtmr4Q91XS1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Mtmr4Q91XS1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Mtmr4Q91XS1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Mtmr4Q91XS1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Mtmr4Q91XS1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Mtmr4Q91XS1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Mtmr4Q91XS1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Mtmr4Q91XS1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Mtmr4Q91XS1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Mtmr4Q91XS1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Mtmr4Q91XS1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Mtmr4Q91XS1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Mtmr4Q91XS1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Mtmr4Q91XS1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Mtmr4Q91XS1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Mtmr4Q91XS1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Mtmr4Q91XS1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Mtmr4Q91XS1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Mtmr4Q91XS1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Mtmr4Q91XS1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Mtmr4Q91XS1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Mtmr4Q91XS1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Mtmr4Q91XS1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Mtmr4Q91XS1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Mtmr4Q91XS1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Mtmr4Q91XS1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,6 ms