Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN0

Lrp5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp5Q91VN0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Lrp5Q91VN0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Lrp5Q91VN0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Lrp5Q91VN0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Lrp5Q91VN0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Lrp5Q91VN0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Lrp5Q91VN0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Lrp5Q91VN0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Lrp5Q91VN0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,73■■■■□ 3,31
Lrp5Q91VN0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Lrp5Q91VN0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Lrp5Q91VN0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Lrp5Q91VN0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Lrp5Q91VN0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Lrp5Q91VN0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Lrp5Q91VN0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,26
Lrp5Q91VN0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Lrp5Q91VN0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Lrp5Q91VN0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Lrp5Q91VN0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35,35■■■■□ 3,25
Lrp5Q91VN0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Lrp5Q91VN0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Lrp5Q91VN0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Lrp5Q91VN0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Lrp5Q91VN0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Lrp5Q91VN0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Lrp5Q91VN0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Lrp5Q91VN0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Lrp5Q91VN0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Lrp5Q91VN0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Lrp5Q91VN0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Lrp5Q91VN0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
Lrp5Q91VN0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Lrp5Q91VN0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Lrp5Q91VN0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Lrp5Q91VN0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Lrp5Q91VN0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Lrp5Q91VN0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Lrp5Q91VN0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Lrp5Q91VN0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Lrp5Q91VN0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Lrp5Q91VN0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Lrp5Q91VN0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Lrp5Q91VN0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34,94■■■■□ 3,18
Lrp5Q91VN0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Lrp5Q91VN0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Lrp5Q91VN0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Lrp5Q91VN0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Lrp5Q91VN0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Lrp5Q91VN0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Lrp5Q91VN0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Lrp5Q91VN0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Lrp5Q91VN0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
Lrp5Q91VN0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,76■■■■□ 3,15
Lrp5Q91VN0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,76■■■■□ 3,15
Lrp5Q91VN0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Lrp5Q91VN0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Lrp5Q91VN0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34,7■■■■□ 3,15
Lrp5Q91VN0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Lrp5Q91VN0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Lrp5Q91VN0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Lrp5Q91VN0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Lrp5Q91VN0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Lrp5Q91VN0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Lrp5Q91VN0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Lrp5Q91VN0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Lrp5Q91VN0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Lrp5Q91VN0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Lrp5Q91VN0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
Lrp5Q91VN0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Lrp5Q91VN0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Lrp5Q91VN0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Lrp5Q91VN0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Lrp5Q91VN0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Lrp5Q91VN0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Lrp5Q91VN0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Lrp5Q91VN0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Lrp5Q91VN0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Lrp5Q91VN0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Lrp5Q91VN0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,32■■■■□ 3,09
Lrp5Q91VN0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Lrp5Q91VN0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Lrp5Q91VN0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Lrp5Q91VN0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Lrp5Q91VN0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Lrp5Q91VN0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Lrp5Q91VN0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Lrp5Q91VN0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Lrp5Q91VN0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Lrp5Q91VN0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Lrp5Q91VN0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Lrp5Q91VN0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Lrp5Q91VN0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Lrp5Q91VN0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Lrp5Q91VN0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Lrp5Q91VN0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Lrp5Q91VN0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Lrp5Q91VN0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Lrp5Q91VN0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Lrp5Q91VN0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,1 ms