Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTY4

Ciapin1, Anamorsin, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciapin1Q8WTY4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Ciapin1Q8WTY4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Ciapin1Q8WTY4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Ciapin1Q8WTY4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Ciapin1Q8WTY4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Ciapin1Q8WTY4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Ciapin1Q8WTY4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,73■■■■□ 3,15
Ciapin1Q8WTY4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Ciapin1Q8WTY4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Ciapin1Q8WTY4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Ciapin1Q8WTY4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Ciapin1Q8WTY4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Ciapin1Q8WTY4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Ciapin1Q8WTY4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Ciapin1Q8WTY4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Ciapin1Q8WTY4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Ciapin1Q8WTY4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Ciapin1Q8WTY4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Ciapin1Q8WTY4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Ciapin1Q8WTY4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Ciapin1Q8WTY4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Ciapin1Q8WTY4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Ciapin1Q8WTY4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Ciapin1Q8WTY4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Ciapin1Q8WTY4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Ciapin1Q8WTY4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Ciapin1Q8WTY4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Ciapin1Q8WTY4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Ciapin1Q8WTY4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Ciapin1Q8WTY4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Ciapin1Q8WTY4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Ciapin1Q8WTY4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Ciapin1Q8WTY4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Ciapin1Q8WTY4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Ciapin1Q8WTY4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Ciapin1Q8WTY4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Ciapin1Q8WTY4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Ciapin1Q8WTY4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ciapin1Q8WTY4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ciapin1Q8WTY4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ciapin1Q8WTY4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ciapin1Q8WTY4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Ciapin1Q8WTY4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Ciapin1Q8WTY4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,99■■■■□ 3,03
Ciapin1Q8WTY4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Ciapin1Q8WTY4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ciapin1Q8WTY4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ciapin1Q8WTY4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Ciapin1Q8WTY4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Ciapin1Q8WTY4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Ciapin1Q8WTY4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Ciapin1Q8WTY4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Ciapin1Q8WTY4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Ciapin1Q8WTY4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Ciapin1Q8WTY4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Ciapin1Q8WTY4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ciapin1Q8WTY4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ciapin1Q8WTY4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Ciapin1Q8WTY4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Ciapin1Q8WTY4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Ciapin1Q8WTY4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Ciapin1Q8WTY4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
Ciapin1Q8WTY4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Ciapin1Q8WTY4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Ciapin1Q8WTY4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Ciapin1Q8WTY4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Ciapin1Q8WTY4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Ciapin1Q8WTY4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ciapin1Q8WTY4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ciapin1Q8WTY4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Ciapin1Q8WTY4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Ciapin1Q8WTY4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Ciapin1Q8WTY4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Ciapin1Q8WTY4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Ciapin1Q8WTY4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Ciapin1Q8WTY4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Ciapin1Q8WTY4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,4■■■□□ 2,94
Ciapin1Q8WTY4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Ciapin1Q8WTY4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Ciapin1Q8WTY4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Ciapin1Q8WTY4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Ciapin1Q8WTY4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
Ciapin1Q8WTY4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ciapin1Q8WTY4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ciapin1Q8WTY4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Ciapin1Q8WTY4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Ciapin1Q8WTY4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Ciapin1Q8WTY4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Ciapin1Q8WTY4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Ciapin1Q8WTY4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Ciapin1Q8WTY4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,22■■■□□ 2,91
Ciapin1Q8WTY4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Ciapin1Q8WTY4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Ciapin1Q8WTY4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Ciapin1Q8WTY4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Ciapin1Q8WTY4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Ciapin1Q8WTY4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Ciapin1Q8WTY4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Ciapin1Q8WTY4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Ciapin1Q8WTY4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms