Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc65Q8VHI7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc65Q8VHI7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc65Q8VHI7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc65Q8VHI7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc65Q8VHI7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc65Q8VHI7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc65Q8VHI7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc65Q8VHI7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc65Q8VHI7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc65Q8VHI7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc65Q8VHI7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc65Q8VHI7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc65Q8VHI7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc65Q8VHI7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc65Q8VHI7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc65Q8VHI7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc65Q8VHI7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc65Q8VHI7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc65Q8VHI7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc65Q8VHI7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc65Q8VHI7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc65Q8VHI7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc65Q8VHI7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc65Q8VHI7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc65Q8VHI7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc65Q8VHI7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc65Q8VHI7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc65Q8VHI7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc65Q8VHI7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc65Q8VHI7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc65Q8VHI7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc65Q8VHI7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc65Q8VHI7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc65Q8VHI7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc65Q8VHI7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc65Q8VHI7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc65Q8VHI7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc65Q8VHI7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc65Q8VHI7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc65Q8VHI7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc65Q8VHI7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc65Q8VHI7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc65Q8VHI7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc65Q8VHI7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc65Q8VHI7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc65Q8VHI7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc65Q8VHI7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc65Q8VHI7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc65Q8VHI7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc65Q8VHI7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc65Q8VHI7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc65Q8VHI7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc65Q8VHI7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc65Q8VHI7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc65Q8VHI7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc65Q8VHI7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc65Q8VHI7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc65Q8VHI7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc65Q8VHI7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc65Q8VHI7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc65Q8VHI7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc65Q8VHI7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc65Q8VHI7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc65Q8VHI7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc65Q8VHI7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc65Q8VHI7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc65Q8VHI7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc65Q8VHI7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc65Q8VHI7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc65Q8VHI7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc65Q8VHI7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc65Q8VHI7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc65Q8VHI7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc65Q8VHI7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc65Q8VHI7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc65Q8VHI7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc65Q8VHI7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc65Q8VHI7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc65Q8VHI7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc65Q8VHI7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc65Q8VHI7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc65Q8VHI7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc65Q8VHI7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc65Q8VHI7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc65Q8VHI7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc65Q8VHI7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc65Q8VHI7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc65Q8VHI7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc65Q8VHI7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms