Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc115Q8VE99 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc115Q8VE99 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc115Q8VE99 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc115Q8VE99 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc115Q8VE99 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc115Q8VE99 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc115Q8VE99 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc115Q8VE99 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc115Q8VE99 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc115Q8VE99 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc115Q8VE99 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc115Q8VE99 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc115Q8VE99 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc115Q8VE99 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc115Q8VE99 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc115Q8VE99 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc115Q8VE99 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc115Q8VE99 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc115Q8VE99 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc115Q8VE99 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc115Q8VE99 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc115Q8VE99 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc115Q8VE99 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc115Q8VE99 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc115Q8VE99 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc115Q8VE99 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc115Q8VE99 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc115Q8VE99 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc115Q8VE99 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc115Q8VE99 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc115Q8VE99 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc115Q8VE99 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc115Q8VE99 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc115Q8VE99 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc115Q8VE99 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc115Q8VE99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc115Q8VE99 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc115Q8VE99 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc115Q8VE99 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc115Q8VE99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc115Q8VE99 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc115Q8VE99 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc115Q8VE99 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc115Q8VE99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc115Q8VE99 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc115Q8VE99 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc115Q8VE99 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc115Q8VE99 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc115Q8VE99 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc115Q8VE99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc115Q8VE99 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc115Q8VE99 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc115Q8VE99 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc115Q8VE99 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc115Q8VE99 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc115Q8VE99 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc115Q8VE99 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc115Q8VE99 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc115Q8VE99 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc115Q8VE99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc115Q8VE99 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc115Q8VE99 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc115Q8VE99 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc115Q8VE99 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc115Q8VE99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc115Q8VE99 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc115Q8VE99 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc115Q8VE99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc115Q8VE99 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc115Q8VE99 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc115Q8VE99 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc115Q8VE99 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms