Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
SnrkQ8VDU5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
SnrkQ8VDU5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
SnrkQ8VDU5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
SnrkQ8VDU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
SnrkQ8VDU5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
SnrkQ8VDU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
SnrkQ8VDU5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,11■■■■□ 3,21
SnrkQ8VDU5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
SnrkQ8VDU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35,08■■■■□ 3,21
SnrkQ8VDU5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
SnrkQ8VDU5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
SnrkQ8VDU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3,19
SnrkQ8VDU5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
SnrkQ8VDU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
SnrkQ8VDU5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
SnrkQ8VDU5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
SnrkQ8VDU5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,94■■■■□ 3,18
SnrkQ8VDU5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
SnrkQ8VDU5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
SnrkQ8VDU5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
SnrkQ8VDU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
SnrkQ8VDU5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,79■■■■□ 3,16
SnrkQ8VDU5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
SnrkQ8VDU5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
SnrkQ8VDU5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
SnrkQ8VDU5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,67■■■■□ 3,14
SnrkQ8VDU5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
SnrkQ8VDU5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
SnrkQ8VDU5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,64■■■■□ 3,14
SnrkQ8VDU5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
SnrkQ8VDU5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
SnrkQ8VDU5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,58■■■■□ 3,13
SnrkQ8VDU5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
SnrkQ8VDU5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
SnrkQ8VDU5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,53■■■■□ 3,12
SnrkQ8VDU5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
SnrkQ8VDU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
SnrkQ8VDU5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,46■■■■□ 3,11
SnrkQ8VDU5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
SnrkQ8VDU5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
SnrkQ8VDU5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
SnrkQ8VDU5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
SnrkQ8VDU5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
SnrkQ8VDU5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
SnrkQ8VDU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
SnrkQ8VDU5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
SnrkQ8VDU5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,25■■■■□ 3,07
SnrkQ8VDU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
SnrkQ8VDU5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
SnrkQ8VDU5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
SnrkQ8VDU5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
SnrkQ8VDU5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
SnrkQ8VDU5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
SnrkQ8VDU5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
SnrkQ8VDU5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,07■■■■□ 3,04
SnrkQ8VDU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
SnrkQ8VDU5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
SnrkQ8VDU5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
SnrkQ8VDU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,99■■■■□ 3,03
SnrkQ8VDU5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
SnrkQ8VDU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
SnrkQ8VDU5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
SnrkQ8VDU5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
SnrkQ8VDU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
SnrkQ8VDU5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
SnrkQ8VDU5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
SnrkQ8VDU5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
SnrkQ8VDU5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33,83■■■■□ 3,01
SnrkQ8VDU5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
SnrkQ8VDU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
SnrkQ8VDU5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
SnrkQ8VDU5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,81■■■■□ 3
SnrkQ8VDU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
SnrkQ8VDU5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
SnrkQ8VDU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,76■■■□□ 2,99
SnrkQ8VDU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
SnrkQ8VDU5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,72■■■□□ 2,99
SnrkQ8VDU5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
SnrkQ8VDU5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
SnrkQ8VDU5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,67■■■□□ 2,98
SnrkQ8VDU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
SnrkQ8VDU5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
SnrkQ8VDU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,64■■■□□ 2,98
SnrkQ8VDU5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33,63■■■□□ 2,97
SnrkQ8VDU5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
SnrkQ8VDU5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
SnrkQ8VDU5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
SnrkQ8VDU5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
SnrkQ8VDU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
SnrkQ8VDU5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,5■■■□□ 2,95
SnrkQ8VDU5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
SnrkQ8VDU5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,49■■■□□ 2,95
SnrkQ8VDU5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
SnrkQ8VDU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
SnrkQ8VDU5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
SnrkQ8VDU5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
SnrkQ8VDU5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
SnrkQ8VDU5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
SnrkQ8VDU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,1 ms