Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam20bQ8VCS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam20bQ8VCS3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fam20bQ8VCS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam20bQ8VCS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam20bQ8VCS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam20bQ8VCS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam20bQ8VCS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam20bQ8VCS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20bQ8VCS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20bQ8VCS3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam20bQ8VCS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam20bQ8VCS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam20bQ8VCS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam20bQ8VCS3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam20bQ8VCS3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam20bQ8VCS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam20bQ8VCS3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam20bQ8VCS3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam20bQ8VCS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam20bQ8VCS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam20bQ8VCS3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam20bQ8VCS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20bQ8VCS3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20bQ8VCS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam20bQ8VCS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam20bQ8VCS3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam20bQ8VCS3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam20bQ8VCS3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam20bQ8VCS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam20bQ8VCS3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20bQ8VCS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20bQ8VCS3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20bQ8VCS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam20bQ8VCS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam20bQ8VCS3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam20bQ8VCS3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam20bQ8VCS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam20bQ8VCS3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam20bQ8VCS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam20bQ8VCS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam20bQ8VCS3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam20bQ8VCS3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam20bQ8VCS3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam20bQ8VCS3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam20bQ8VCS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam20bQ8VCS3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam20bQ8VCS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20bQ8VCS3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20bQ8VCS3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20bQ8VCS3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20bQ8VCS3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam20bQ8VCS3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam20bQ8VCS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam20bQ8VCS3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam20bQ8VCS3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam20bQ8VCS3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam20bQ8VCS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20bQ8VCS3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam20bQ8VCS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam20bQ8VCS3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam20bQ8VCS3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam20bQ8VCS3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam20bQ8VCS3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20bQ8VCS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20bQ8VCS3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam20bQ8VCS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam20bQ8VCS3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam20bQ8VCS3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam20bQ8VCS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam20bQ8VCS3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam20bQ8VCS3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam20bQ8VCS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam20bQ8VCS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20bQ8VCS3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam20bQ8VCS3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms