Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
TxlnbQ8VBT1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
TxlnbQ8VBT1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
TxlnbQ8VBT1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
TxlnbQ8VBT1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
TxlnbQ8VBT1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
TxlnbQ8VBT1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
TxlnbQ8VBT1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
TxlnbQ8VBT1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
TxlnbQ8VBT1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
TxlnbQ8VBT1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
TxlnbQ8VBT1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
TxlnbQ8VBT1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
TxlnbQ8VBT1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
TxlnbQ8VBT1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
TxlnbQ8VBT1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
TxlnbQ8VBT1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
TxlnbQ8VBT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
TxlnbQ8VBT1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
TxlnbQ8VBT1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
TxlnbQ8VBT1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
TxlnbQ8VBT1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
TxlnbQ8VBT1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
TxlnbQ8VBT1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
TxlnbQ8VBT1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
TxlnbQ8VBT1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
TxlnbQ8VBT1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
TxlnbQ8VBT1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,63■■■□□ 2,17
TxlnbQ8VBT1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
TxlnbQ8VBT1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,58■■■□□ 2,17
TxlnbQ8VBT1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
TxlnbQ8VBT1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
TxlnbQ8VBT1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
TxlnbQ8VBT1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
TxlnbQ8VBT1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
TxlnbQ8VBT1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
TxlnbQ8VBT1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
TxlnbQ8VBT1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
TxlnbQ8VBT1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
TxlnbQ8VBT1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
TxlnbQ8VBT1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
TxlnbQ8VBT1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
TxlnbQ8VBT1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
TxlnbQ8VBT1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
TxlnbQ8VBT1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
TxlnbQ8VBT1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,29■■■□□ 2,12
TxlnbQ8VBT1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
TxlnbQ8VBT1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
TxlnbQ8VBT1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
TxlnbQ8VBT1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
TxlnbQ8VBT1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
TxlnbQ8VBT1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
TxlnbQ8VBT1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
TxlnbQ8VBT1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
TxlnbQ8VBT1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
TxlnbQ8VBT1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
TxlnbQ8VBT1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
TxlnbQ8VBT1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
TxlnbQ8VBT1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,09■■■□□ 2,09
TxlnbQ8VBT1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
TxlnbQ8VBT1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
TxlnbQ8VBT1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
TxlnbQ8VBT1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
TxlnbQ8VBT1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
TxlnbQ8VBT1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
TxlnbQ8VBT1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
TxlnbQ8VBT1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
TxlnbQ8VBT1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
TxlnbQ8VBT1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
TxlnbQ8VBT1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
TxlnbQ8VBT1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
TxlnbQ8VBT1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
TxlnbQ8VBT1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
TxlnbQ8VBT1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
TxlnbQ8VBT1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
TxlnbQ8VBT1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
TxlnbQ8VBT1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
TxlnbQ8VBT1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
TxlnbQ8VBT1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
TxlnbQ8VBT1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
TxlnbQ8VBT1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
TxlnbQ8VBT1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
TxlnbQ8VBT1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
TxlnbQ8VBT1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
TxlnbQ8VBT1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
TxlnbQ8VBT1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
TxlnbQ8VBT1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
TxlnbQ8VBT1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
TxlnbQ8VBT1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,7 ms