Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gipc3Q8R5M0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gipc3Q8R5M0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gipc3Q8R5M0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gipc3Q8R5M0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gipc3Q8R5M0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gipc3Q8R5M0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gipc3Q8R5M0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gipc3Q8R5M0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gipc3Q8R5M0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gipc3Q8R5M0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gipc3Q8R5M0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gipc3Q8R5M0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gipc3Q8R5M0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gipc3Q8R5M0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gipc3Q8R5M0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gipc3Q8R5M0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gipc3Q8R5M0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gipc3Q8R5M0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gipc3Q8R5M0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gipc3Q8R5M0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gipc3Q8R5M0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gipc3Q8R5M0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gipc3Q8R5M0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gipc3Q8R5M0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gipc3Q8R5M0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gipc3Q8R5M0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gipc3Q8R5M0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gipc3Q8R5M0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gipc3Q8R5M0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gipc3Q8R5M0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gipc3Q8R5M0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gipc3Q8R5M0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gipc3Q8R5M0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gipc3Q8R5M0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gipc3Q8R5M0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gipc3Q8R5M0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gipc3Q8R5M0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gipc3Q8R5M0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gipc3Q8R5M0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gipc3Q8R5M0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gipc3Q8R5M0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gipc3Q8R5M0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gipc3Q8R5M0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gipc3Q8R5M0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gipc3Q8R5M0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gipc3Q8R5M0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gipc3Q8R5M0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gipc3Q8R5M0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gipc3Q8R5M0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gipc3Q8R5M0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gipc3Q8R5M0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gipc3Q8R5M0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gipc3Q8R5M0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gipc3Q8R5M0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc3Q8R5M0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc3Q8R5M0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gipc3Q8R5M0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gipc3Q8R5M0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gipc3Q8R5M0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gipc3Q8R5M0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gipc3Q8R5M0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gipc3Q8R5M0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gipc3Q8R5M0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gipc3Q8R5M0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gipc3Q8R5M0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gipc3Q8R5M0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gipc3Q8R5M0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gipc3Q8R5M0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gipc3Q8R5M0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gipc3Q8R5M0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gipc3Q8R5M0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gipc3Q8R5M0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gipc3Q8R5M0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gipc3Q8R5M0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc3Q8R5M0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc3Q8R5M0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gipc3Q8R5M0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc3Q8R5M0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc3Q8R5M0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc3Q8R5M0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc3Q8R5M0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc3Q8R5M0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc3Q8R5M0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gipc3Q8R5M0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc3Q8R5M0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc3Q8R5M0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc3Q8R5M0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc3Q8R5M0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc3Q8R5M0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc3Q8R5M0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms