Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Colec12Q8K4Q8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Colec12Q8K4Q8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Colec12Q8K4Q8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Colec12Q8K4Q8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Colec12Q8K4Q8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Colec12Q8K4Q8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Colec12Q8K4Q8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Colec12Q8K4Q8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Colec12Q8K4Q8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Colec12Q8K4Q8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Colec12Q8K4Q8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Colec12Q8K4Q8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Colec12Q8K4Q8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Colec12Q8K4Q8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Colec12Q8K4Q8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Colec12Q8K4Q8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Colec12Q8K4Q8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Colec12Q8K4Q8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Colec12Q8K4Q8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Colec12Q8K4Q8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Colec12Q8K4Q8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Colec12Q8K4Q8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Colec12Q8K4Q8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Colec12Q8K4Q8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Colec12Q8K4Q8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Colec12Q8K4Q8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Colec12Q8K4Q8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Colec12Q8K4Q8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Colec12Q8K4Q8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Colec12Q8K4Q8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Colec12Q8K4Q8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Colec12Q8K4Q8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Colec12Q8K4Q8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Colec12Q8K4Q8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Colec12Q8K4Q8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Colec12Q8K4Q8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Colec12Q8K4Q8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Colec12Q8K4Q8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Colec12Q8K4Q8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Colec12Q8K4Q8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Colec12Q8K4Q8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Colec12Q8K4Q8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Colec12Q8K4Q8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Colec12Q8K4Q8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Colec12Q8K4Q8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Colec12Q8K4Q8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Colec12Q8K4Q8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Colec12Q8K4Q8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Colec12Q8K4Q8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Colec12Q8K4Q8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Colec12Q8K4Q8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Colec12Q8K4Q8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Colec12Q8K4Q8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Colec12Q8K4Q8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Colec12Q8K4Q8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Colec12Q8K4Q8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Colec12Q8K4Q8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Colec12Q8K4Q8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Colec12Q8K4Q8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Colec12Q8K4Q8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Colec12Q8K4Q8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Colec12Q8K4Q8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Colec12Q8K4Q8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Colec12Q8K4Q8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Colec12Q8K4Q8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Colec12Q8K4Q8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Colec12Q8K4Q8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Colec12Q8K4Q8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Colec12Q8K4Q8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Colec12Q8K4Q8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Colec12Q8K4Q8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Colec12Q8K4Q8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Colec12Q8K4Q8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Colec12Q8K4Q8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Colec12Q8K4Q8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Colec12Q8K4Q8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Colec12Q8K4Q8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Colec12Q8K4Q8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Colec12Q8K4Q8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Colec12Q8K4Q8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Colec12Q8K4Q8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Colec12Q8K4Q8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Colec12Q8K4Q8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Colec12Q8K4Q8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Colec12Q8K4Q8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Colec12Q8K4Q8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Colec12Q8K4Q8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Colec12Q8K4Q8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Colec12Q8K4Q8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Colec12Q8K4Q8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Colec12Q8K4Q8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Colec12Q8K4Q8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Colec12Q8K4Q8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Colec12Q8K4Q8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Colec12Q8K4Q8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Colec12Q8K4Q8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Colec12Q8K4Q8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms