Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gin1Q8K259 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gin1Q8K259 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gin1Q8K259 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gin1Q8K259 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gin1Q8K259 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gin1Q8K259 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gin1Q8K259 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gin1Q8K259 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gin1Q8K259 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gin1Q8K259 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gin1Q8K259 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gin1Q8K259 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gin1Q8K259 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gin1Q8K259 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gin1Q8K259 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gin1Q8K259 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gin1Q8K259 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gin1Q8K259 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gin1Q8K259 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gin1Q8K259 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gin1Q8K259 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gin1Q8K259 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gin1Q8K259 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gin1Q8K259 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gin1Q8K259 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gin1Q8K259 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gin1Q8K259 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gin1Q8K259 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gin1Q8K259 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gin1Q8K259 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gin1Q8K259 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gin1Q8K259 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gin1Q8K259 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gin1Q8K259 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gin1Q8K259 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gin1Q8K259 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gin1Q8K259 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gin1Q8K259 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gin1Q8K259 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gin1Q8K259 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gin1Q8K259 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gin1Q8K259 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gin1Q8K259 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gin1Q8K259 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gin1Q8K259 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gin1Q8K259 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gin1Q8K259 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gin1Q8K259 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gin1Q8K259 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gin1Q8K259 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gin1Q8K259 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gin1Q8K259 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gin1Q8K259 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gin1Q8K259 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gin1Q8K259 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gin1Q8K259 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gin1Q8K259 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gin1Q8K259 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gin1Q8K259 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gin1Q8K259 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gin1Q8K259 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gin1Q8K259 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gin1Q8K259 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gin1Q8K259 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gin1Q8K259 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gin1Q8K259 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gin1Q8K259 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gin1Q8K259 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gin1Q8K259 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gin1Q8K259 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gin1Q8K259 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gin1Q8K259 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gin1Q8K259 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gin1Q8K259 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gin1Q8K259 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gin1Q8K259 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gin1Q8K259 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gin1Q8K259 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gin1Q8K259 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gin1Q8K259 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gin1Q8K259 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gin1Q8K259 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms