Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S5

Klf11, Krueppel-like factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf11Q8K1S5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klf11Q8K1S5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Klf11Q8K1S5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klf11Q8K1S5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klf11Q8K1S5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klf11Q8K1S5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klf11Q8K1S5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klf11Q8K1S5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klf11Q8K1S5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klf11Q8K1S5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klf11Q8K1S5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klf11Q8K1S5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klf11Q8K1S5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klf11Q8K1S5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klf11Q8K1S5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Klf11Q8K1S5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klf11Q8K1S5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klf11Q8K1S5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klf11Q8K1S5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Klf11Q8K1S5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klf11Q8K1S5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klf11Q8K1S5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klf11Q8K1S5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klf11Q8K1S5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf11Q8K1S5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klf11Q8K1S5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klf11Q8K1S5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klf11Q8K1S5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klf11Q8K1S5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klf11Q8K1S5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klf11Q8K1S5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klf11Q8K1S5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klf11Q8K1S5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf11Q8K1S5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf11Q8K1S5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf11Q8K1S5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf11Q8K1S5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf11Q8K1S5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Klf11Q8K1S5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klf11Q8K1S5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klf11Q8K1S5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klf11Q8K1S5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klf11Q8K1S5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klf11Q8K1S5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klf11Q8K1S5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klf11Q8K1S5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf11Q8K1S5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf11Q8K1S5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf11Q8K1S5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klf11Q8K1S5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klf11Q8K1S5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf11Q8K1S5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf11Q8K1S5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klf11Q8K1S5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klf11Q8K1S5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf11Q8K1S5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf11Q8K1S5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klf11Q8K1S5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klf11Q8K1S5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klf11Q8K1S5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klf11Q8K1S5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klf11Q8K1S5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Klf11Q8K1S5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klf11Q8K1S5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klf11Q8K1S5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klf11Q8K1S5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klf11Q8K1S5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Klf11Q8K1S5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klf11Q8K1S5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klf11Q8K1S5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf11Q8K1S5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf11Q8K1S5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf11Q8K1S5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf11Q8K1S5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf11Q8K1S5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klf11Q8K1S5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Klf11Q8K1S5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klf11Q8K1S5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klf11Q8K1S5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms