Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt33aQ8K0Y2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt33aQ8K0Y2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt33aQ8K0Y2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt33aQ8K0Y2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt33aQ8K0Y2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt33aQ8K0Y2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt33aQ8K0Y2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt33aQ8K0Y2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt33aQ8K0Y2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt33aQ8K0Y2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt33aQ8K0Y2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt33aQ8K0Y2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt33aQ8K0Y2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt33aQ8K0Y2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt33aQ8K0Y2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt33aQ8K0Y2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt33aQ8K0Y2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt33aQ8K0Y2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt33aQ8K0Y2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt33aQ8K0Y2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt33aQ8K0Y2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt33aQ8K0Y2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt33aQ8K0Y2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt33aQ8K0Y2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt33aQ8K0Y2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt33aQ8K0Y2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt33aQ8K0Y2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt33aQ8K0Y2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt33aQ8K0Y2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt33aQ8K0Y2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt33aQ8K0Y2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt33aQ8K0Y2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt33aQ8K0Y2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt33aQ8K0Y2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt33aQ8K0Y2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt33aQ8K0Y2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt33aQ8K0Y2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt33aQ8K0Y2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt33aQ8K0Y2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt33aQ8K0Y2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt33aQ8K0Y2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt33aQ8K0Y2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt33aQ8K0Y2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt33aQ8K0Y2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt33aQ8K0Y2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt33aQ8K0Y2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt33aQ8K0Y2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt33aQ8K0Y2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt33aQ8K0Y2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt33aQ8K0Y2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt33aQ8K0Y2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt33aQ8K0Y2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt33aQ8K0Y2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt33aQ8K0Y2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt33aQ8K0Y2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt33aQ8K0Y2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt33aQ8K0Y2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt33aQ8K0Y2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt33aQ8K0Y2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt33aQ8K0Y2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt33aQ8K0Y2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt33aQ8K0Y2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt33aQ8K0Y2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt33aQ8K0Y2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt33aQ8K0Y2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt33aQ8K0Y2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt33aQ8K0Y2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms