Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Krt33aQ8K0Y2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
Krt33aQ8K0Y2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Krt33aQ8K0Y2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Krt33aQ8K0Y2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Krt33aQ8K0Y2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Krt33aQ8K0Y2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Krt33aQ8K0Y2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Krt33aQ8K0Y2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Krt33aQ8K0Y2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Krt33aQ8K0Y2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Krt33aQ8K0Y2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Krt33aQ8K0Y2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Krt33aQ8K0Y2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Krt33aQ8K0Y2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Krt33aQ8K0Y2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Krt33aQ8K0Y2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Krt33aQ8K0Y2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,36
Krt33aQ8K0Y2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Krt33aQ8K0Y2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Krt33aQ8K0Y2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Krt33aQ8K0Y2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Krt33aQ8K0Y2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Krt33aQ8K0Y2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Krt33aQ8K0Y2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Krt33aQ8K0Y2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Krt33aQ8K0Y2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Krt33aQ8K0Y2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Krt33aQ8K0Y2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Krt33aQ8K0Y2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Krt33aQ8K0Y2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Krt33aQ8K0Y2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Krt33aQ8K0Y2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Krt33aQ8K0Y2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Krt33aQ8K0Y2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Krt33aQ8K0Y2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Krt33aQ8K0Y2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Krt33aQ8K0Y2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Krt33aQ8K0Y2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Krt33aQ8K0Y2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Krt33aQ8K0Y2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Krt33aQ8K0Y2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Krt33aQ8K0Y2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Krt33aQ8K0Y2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Krt33aQ8K0Y2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Krt33aQ8K0Y2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Krt33aQ8K0Y2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Krt33aQ8K0Y2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,01■■□□□ 1,27
Krt33aQ8K0Y2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Krt33aQ8K0Y2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Krt33aQ8K0Y2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Krt33aQ8K0Y2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Krt33aQ8K0Y2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Krt33aQ8K0Y2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Krt33aQ8K0Y2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Krt33aQ8K0Y2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Krt33aQ8K0Y2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Krt33aQ8K0Y2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Krt33aQ8K0Y2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Krt33aQ8K0Y2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Krt33aQ8K0Y2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Krt33aQ8K0Y2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
Krt33aQ8K0Y2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Krt33aQ8K0Y2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Krt33aQ8K0Y2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,81■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,8■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
Krt33aQ8K0Y2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Krt33aQ8K0Y2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Krt33aQ8K0Y2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms