Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp27Q8CEG8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp27Q8CEG8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp27Q8CEG8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp27Q8CEG8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp27Q8CEG8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp27Q8CEG8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp27Q8CEG8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp27Q8CEG8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp27Q8CEG8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp27Q8CEG8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp27Q8CEG8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp27Q8CEG8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp27Q8CEG8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp27Q8CEG8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp27Q8CEG8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp27Q8CEG8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp27Q8CEG8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp27Q8CEG8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp27Q8CEG8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp27Q8CEG8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp27Q8CEG8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp27Q8CEG8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp27Q8CEG8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp27Q8CEG8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp27Q8CEG8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp27Q8CEG8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp27Q8CEG8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp27Q8CEG8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp27Q8CEG8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp27Q8CEG8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp27Q8CEG8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp27Q8CEG8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp27Q8CEG8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp27Q8CEG8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp27Q8CEG8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp27Q8CEG8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp27Q8CEG8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Usp27Q8CEG8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp27Q8CEG8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp27Q8CEG8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp27Q8CEG8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp27Q8CEG8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp27Q8CEG8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp27Q8CEG8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp27Q8CEG8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp27Q8CEG8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp27Q8CEG8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp27Q8CEG8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp27Q8CEG8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp27Q8CEG8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp27Q8CEG8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp27Q8CEG8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp27Q8CEG8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp27Q8CEG8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp27Q8CEG8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp27Q8CEG8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp27Q8CEG8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp27Q8CEG8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp27Q8CEG8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp27Q8CEG8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp27Q8CEG8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp27Q8CEG8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp27Q8CEG8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp27Q8CEG8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp27Q8CEG8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp27Q8CEG8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp27Q8CEG8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp27Q8CEG8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp27Q8CEG8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp27Q8CEG8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp27Q8CEG8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp27Q8CEG8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp27Q8CEG8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp27Q8CEG8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp27Q8CEG8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp27Q8CEG8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp27Q8CEG8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
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