Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccdc28bQ8CEG5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ccdc28bQ8CEG5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ccdc28bQ8CEG5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc28bQ8CEG5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc28bQ8CEG5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc28bQ8CEG5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ccdc28bQ8CEG5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ccdc28bQ8CEG5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc28bQ8CEG5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc28bQ8CEG5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc28bQ8CEG5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ccdc28bQ8CEG5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc28bQ8CEG5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ccdc28bQ8CEG5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc28bQ8CEG5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Ccdc28bQ8CEG5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ccdc28bQ8CEG5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Ccdc28bQ8CEG5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ccdc28bQ8CEG5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc28bQ8CEG5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc28bQ8CEG5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ccdc28bQ8CEG5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ccdc28bQ8CEG5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ccdc28bQ8CEG5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ccdc28bQ8CEG5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc28bQ8CEG5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Ccdc28bQ8CEG5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ccdc28bQ8CEG5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Ccdc28bQ8CEG5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Ccdc28bQ8CEG5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ccdc28bQ8CEG5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc28bQ8CEG5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc28bQ8CEG5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc28bQ8CEG5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Ccdc28bQ8CEG5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Ccdc28bQ8CEG5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ccdc28bQ8CEG5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ccdc28bQ8CEG5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc28bQ8CEG5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ccdc28bQ8CEG5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ccdc28bQ8CEG5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc28bQ8CEG5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Ccdc28bQ8CEG5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Ccdc28bQ8CEG5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc28bQ8CEG5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc28bQ8CEG5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc28bQ8CEG5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc28bQ8CEG5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc28bQ8CEG5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc28bQ8CEG5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc28bQ8CEG5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,09■■□□□ 1,77
Ccdc28bQ8CEG5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc28bQ8CEG5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc28bQ8CEG5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc28bQ8CEG5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ccdc28bQ8CEG5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ccdc28bQ8CEG5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Ccdc28bQ8CEG5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc28bQ8CEG5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc28bQ8CEG5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc28bQ8CEG5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc28bQ8CEG5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc28bQ8CEG5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc28bQ8CEG5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc28bQ8CEG5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc28bQ8CEG5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc28bQ8CEG5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc28bQ8CEG5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ccdc28bQ8CEG5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ccdc28bQ8CEG5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ccdc28bQ8CEG5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ccdc28bQ8CEG5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ccdc28bQ8CEG5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ccdc28bQ8CEG5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms