Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nhlrc3Q8CCH2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nhlrc3Q8CCH2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nhlrc3Q8CCH2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhlrc3Q8CCH2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhlrc3Q8CCH2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhlrc3Q8CCH2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhlrc3Q8CCH2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhlrc3Q8CCH2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhlrc3Q8CCH2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhlrc3Q8CCH2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhlrc3Q8CCH2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhlrc3Q8CCH2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhlrc3Q8CCH2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhlrc3Q8CCH2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhlrc3Q8CCH2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhlrc3Q8CCH2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nhlrc3Q8CCH2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhlrc3Q8CCH2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhlrc3Q8CCH2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhlrc3Q8CCH2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhlrc3Q8CCH2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhlrc3Q8CCH2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhlrc3Q8CCH2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhlrc3Q8CCH2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhlrc3Q8CCH2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nhlrc3Q8CCH2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nhlrc3Q8CCH2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nhlrc3Q8CCH2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nhlrc3Q8CCH2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nhlrc3Q8CCH2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhlrc3Q8CCH2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhlrc3Q8CCH2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlrc3Q8CCH2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlrc3Q8CCH2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlrc3Q8CCH2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlrc3Q8CCH2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlrc3Q8CCH2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlrc3Q8CCH2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc3Q8CCH2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlrc3Q8CCH2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhlrc3Q8CCH2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhlrc3Q8CCH2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlrc3Q8CCH2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlrc3Q8CCH2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms