Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930507D05RikQ8C9C9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930507D05RikQ8C9C9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930507D05RikQ8C9C9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930507D05RikQ8C9C9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930507D05RikQ8C9C9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930507D05RikQ8C9C9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930507D05RikQ8C9C9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930507D05RikQ8C9C9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930507D05RikQ8C9C9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
4930507D05RikQ8C9C9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930507D05RikQ8C9C9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms